一种去除动物总RNA中的核糖体RNA的方法发明专利.pdfVIP

一种去除动物总RNA中的核糖体RNA的方法发明专利.pdf

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(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113122533 A (43)申请公布日 2021.07.16 (21)申请号 202010056986.X (22)申请日 2020.01.16 (71)申请人 深圳华大基因股份有限公司 地址 518083 广东省深圳市盐田区洪安三 街21号华大综合园7栋7层-14层 (72)发明人 冯兵 张东  (74)专利代理机构 北京纪凯知识产权代理有限 公司 11245 代理人 何叶喧 (51)Int.Cl. C12N 15/10(2006.01) 权利要求书1页 说明书6页 序列表7页 附图3页 (54)发明名称 一种去除动物总RNA中的核糖体RNA的方法 (57)摘要 本发明公开了一种去除动物总RNA中的核糖 体RNA的方法。本发明提供了一种去除动物总RNA 样本中的rRNA的方法,依次包括如下步骤:(1)取 动物总RNA样本,进行变性,然后采用特异引物组 进行反转录;所述特异引物组由若干条rRNA特异 性反转录引物组成;(2)采用RNase H酶进行处 理;(3)采用DNase I进行处理;(4)回收RNA。本发 明提供的方法具有以下优势:(1)从动物总RNA样 本中特异性去除rRNA,保留了其他目标RNA如 mRNA、LncRNA等,适宜于LncRNA测序;(2)物种耐 受度高,广泛适用于哺乳类、鸟类、爬行类、两栖 类、鱼类及昆虫类等总RNA样本中rRNA的去除; A (3)操作简单、成本低廉且适宜于批量自动化工 3 作站操作。 3 5 2 2 1 3 1 1 N C CN 113122533 A 权 利 要 求 书 1/1 页 1.一种去除动物总RNA样本中的rRNA的方法,依次包括如下步骤: (1)取动物总RNA样本,进行变性,然后采用特异引物组进行反转录;所述特异引物组由 若干条rRNA特异性反转录引物组成; (2)采用RNase H酶进行处理; (3)采用DNase  I进行处理; (4)回收RNA。 2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:所述特异引物组由40种引物组成,依次如序 列表的序列1至序列表的序列40所示。 3.权利要求1或2所述方法在制备RNA文库中的应用。 4.权利要求1或2所述方法在RNA测序中的应用。 5.特异引物组,由40种引物组成,依次如序列表的序列1至序列表的序列40所示。 6.权利要求5所述特异引物组在去除动物总RNA样本中的rRNA中的应用。 7.权利要求5所述特异引物组在制备RNA文库中的应用。 8.权利要求5所述特异引物组在RNA测序中的应用。 9.一种去除动物总RNA样本中的rRNA的试剂盒,包括元件甲、元件乙和元件丙; 所述元件甲用于rRNA的特异性反转录; 所述元件乙用于特异性消化DNA-RNA杂交双链中的RNA链; 所述元件丙用于消化DNA。 10.如权利要求9所述的试剂盒,其特征在于: 所述元件甲包括元件甲-1和元件甲-2;所述元件甲-1为特异引物组,所述特异引物组 由若干条rRNA特异性反转录引物组成;所述元件甲-2包括用于进行反转录的试剂盒或试剂 或试剂组合; 所述元件乙包括用于特异性消化DNA-RNA杂交双链中的RNA链的试剂盒或试剂或试剂 组合; 所述元件丙包

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