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(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 111032885 A
(43)申请公布日
2020.04.17
(21)申请号 201780093704.X (74)专利代理机构 北京品源专利代理有限公司
11332
(22)申请日 2017.09.07
代理人 刘锴 周瑞
(85)PCT国际申请进入国家阶段日
(51)Int.Cl.
2020.02.06
C12Q 1/70(2006.01)
(86)PCT国际申请的申请数据
PCT/CN2017/100927 2017.09.07
(87)PCT国际申请的公布数据
WO2019/047109 ZH 2019.03.14
(71)申请人 深圳华大基因股份有限公司
地址 518083 广东省深圳市盐田区洪安三
街21号华大综合园7栋7层-14层
(72)发明人 柴相花 王书元 刘强 袁玉英
张红云 刘娜 尹烨
(54)发明名称
一种HPV精确分型的生物信息学分析方法及
系统
(57)摘要
本发明公开了一种HPV精确分型的生物信息
学分型方法及系统,所述方法包括:接收高通量
测序技术得到的测序片段,得到每个样本的
reads序列;将所有样本的reads序列进行分组聚
类,将聚类后的reads序列与HPV参考序列集进行
比对和筛选,确定筛选后的reads序列的匹配结
果;对确定HPV型别的reads序列采用LDA模型进
行HPV分型,最终确认每个reads序列的HPV型别。
A
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