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实验四;1.掌握Southern blotting的原理和方法
2.了解探针标记的原理和方法;一.Southern blotting
二.探针标记;印迹技术 ;类型;转膜方法;中文名称;核酸/蛋白质的制备;DNA印迹技术;制备样品DNA;凝胶;(一)探针的概念
是带有特殊可检测标记的核酸片段,它具有已知的序列,能够与待测的核酸片段互补结合,可以用于检测核酸样品中的特定核酸片段。; ⑴. DNA探针;
探针标记物 (Marker of probe)
①.(放射性)核素/同位素标记物
;标记方法;探针标记方法
根据标记的位置不同可以分为:
末端标记 (Ending Labeling)
标记物位于探针的3’末端或5’末端
均一标记 (Uniform labeling)
标记物位于探针内部;化学标记法;缺口平移法(nick translation)
随机引物法(random primer labeling)
末端标记法
PCR标记法;;;1.制备样品DNA
2.限制酶酶切DNA分子 ; 本实验采用实验一制备并保存的小鼠基因组DNA; 取3支1.5mL离心管,按照下表所列加组分加入相应试剂: ; (二)PCR扩增
以阳性重组质粒为模版扩增目的DNA(G6PD);1. 样品准备:
取上述准备的样品上样,基因组DNA(20μL)\PCR (10μL) 、MARKER (5μL);;2. 电泳
调电压100V,电泳40分钟左右,紫外灯观察电泳结果,照相保存。 ;(为杂交做准备)
方法:随机引物标记法
用酶标亲和素进行检测
DNA 模版为纯化的PCR产物 ;第一天;1.脱嘌呤:将琼脂糖凝胶块浸泡入10倍体积的0.25M HCL中振摇5min ,至溴酚蓝条带转变为黄色,继续振摇5min
2.变性:去HCL溶液,加入10倍体积变性液,振摇20min;更换变性液,再振摇20min
3.漂洗:去变性液,用蒸馏水漂洗一遍
4.中和:加入5倍体积中和液,振摇20min,更换中和液,再振摇20min ;1.准备转移模板
2.准备硝酸纤维素膜
3.过夜转移 ;1. 标记:取下硝酸纤维素膜,标记含DNA面和方位
2. 漂洗: 2×SSC,漂洗
3. 干燥: 滤纸上晾干后,于80℃烤箱,烘烤60~120min。立即用于杂交或封存于塑料袋中于4℃保存备用 ;将硝酸纤维素膜漂浮于6×SSC液面
完全浸透,浸泡于其中
立即取出,封入塑料膜中
留有空隙侧剪开一角,汲去多余液体,加入预杂交液 (0.1-0.2mL/cm2)
驱净气泡,封闭塑料膜
42℃保温0.5~1h;;剪开有空隙侧的另一角,加入变性处理???的标记探针
驱除气体,封口
反复颠倒混匀杂交袋
42℃保温过夜;取一个盘子,加入2×SSC-0.1%SDS 100mL
取出杂交袋,快速取出硝酸纤维素膜
立即转移入2×SSC-0.1%SDS中,轻轻振摇,漂洗5min
换2×SSC-0.1%SDS,再漂洗5min
用0.2×SSC-0.1%SDS,50℃漂洗15min ;将干燥的硝酸纤维素膜漂浮在50mLTBS缓冲液上震摇5min
转移入10ml 封闭液中
37℃振摇30-60min;去除封闭液,加入10mLTBS
按比例加入辣根过氧化物酶酶标链亲和素 (1-5μL/mLTBS)
25℃振摇保温30~60min;1.漂洗
25mL漂洗液中振摇5min,漂洗三遍
2.显示
沥去液体,加入显色液,轻轻振摇至显色深度不再增加,放入水中漂洗,停止显色
3.照相
4.干燥:滤纸上干燥,保存;
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