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BIOPYTHON
中
文
指
南
生物信息学论坛 2010 倾情奉献
2010 年第一版年第一版
生物信息学论坛工作
Biopython 中文指南 生物信息学论坛 倾力奉献
目录
前言 1
第一章 介绍 2
1.1 什么是 biopython ？ 2
1.1.1 在 biopython 工具包中能够发现什么 2
1.2 安装 biopythonbiopython 3
.
1.3 FAQFAQ3
第二章 快速开始 -可以用 biopython 来做什么？ 4
2.1 General overview of what Biopython providesprovides4
2.2 处理序列 4
2.3 一个使用的例子 5
2.4 分析序列文件格式 6
2.4.1 简单的 FASTA 分析例子 6
2.4.2 简单的 GenBank 分析例子 7
2.4.3 我喜欢分析 -请不要停止讨论它！ 8
2.5 连接生物学数据库 9
.
2.6 下一步 ??9
第三章 序列对象 10
3.1 序列和字母表 10
3.2 序列像字符串一样起作用 11
3.2.1 序列分片 12
3.2.2 把 Seq 对象转化为字符串 13
3.2.3 核酸序列及（反转）互补 13
3.2.4 连接或增加序列 14
3.3 可变的 Seq 对象 15
3.4 转录和翻译 16
3.5 与字符串一起工作 18
第四章 序列输入 /输出 19
4.1 分析或读取序列 19
4.1.1 读取序列文件 19
4.1.2 在序列文件中重复记录 20
4.1.3 在一个序列文件中得到记录列表 21
4.1.4 提取数据 22
4.2 从网上分析序列 24
4.2.1 从网上分析 GenBank 记录 24
4.2.2 从网上分析 SwissProt 序列 26
4.3 序列文件作为字典 27
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