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中国林蛙皮肤抗菌肽基因的cDNA克隆
646中国兽医学报2006年11月第26卷第6期c^抽。,y“5fiNov.2006V01.26No.6中国林蛙皮肤抗菌肽基因的cDNA克隆 乔红伟1,韩俊友o,赵瑞利1,郑伟2,韩艳1,韩文瑜卜(1.吉林大学畜牧兽医学院.吉林长春130062;2.吉林省水产研究院,吉林长春130062) 中国兽医学报2006年11月第26卷.第6期C^锄Jy甜SciNov.2006V01.26No.6647 图1中国林蛙皮肤总RNA电泳结果1,2.3.RNA 图2RT—PcR电泳结果1.扩增的目的条带261bp;2.DL2000Marker 通过与相近无尾两栖类抗菌肽序列进行比较。发现序列为一个新的蛙皮肤抗菌肽序列。总共有53个氨基酸残基,个别氨基酸为D一氨基酸,C端有酰胺化修饰,且序列与相近无尾两栖类抗菌肽序列同源性为80%。 2.3活性检测结果先从大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、枯草杆菌、蜡样芽孢杆菌、白色念珠菌、链球菌中筛选出对提取皮肤活性物质敏感的受试菌,对其中金黄色葡萄球菌、李氏杆菌、绿脓杆菌、枯草杆菌、蜡样芽孢杆菌、链球菌有抑菌作用。以李氏杆菌作为受试菌,分别将抗生素按不同浓度稀释,进行抑菌实验,抑菌环大小表明当氨苄青霉素(20pL)、卡那霉素(20pL)、环丙沙星(20pI。)、四环素(20弘L)时的抑菌环直径为20mm。与50”I。抗菌肽的抑菌环直径大约相等。 图3抗菌肽活力单位的测定1.氨苄青霉索(2lmm);2.卡那霉素(20mm);3.环呙沙星(20mm);4.四环素(22mm);5. 抗菌肽活性物质(】9mm);6.PBS(Omm) 3讨论 在脊椎动物演化过程中,两栖动物是由水生到陆生的过渡型,其中很多物种具有食用或药用价值,两栖动物皮肤在自然进化过程中形成了防御病原微生物的3套防御系统.相应地具有特定结构。皮肤抗菌肽是其中先天性防御系统的主要组成部分,两栖动物皮肤抗菌肽具有高效、广谱、不易产生耐药性等特点。这使其在耐抗生素病原菌株大量涌现的今天有望成为新一代的临床抗菌药物,并成为当前耐药性研究的热点。 目前在GenBank中收录的有关无尾两栖类抗菌肽的核苷酸序列与蛙皮肤抗菌肽相似的也不少;来自于AJ251566,AJ427746,S69903,u22392.x7783l,Y09393等,它们大约都在310bp左右,有一个完整的开放阅读框(()RF)它们的oRF在氨基酸82~380bp之间。它们之间的同源性在80%左右。因此,对于证明来自于蛙皮肤抗菌肽的确定的氨基酸序列是非常必要的。 最近有研究表明,蛙皮抗菌肽链一般有11个氨基酸残基到47个氨基酸残基构成。除了Distinctin为2条链外,其他的蛙皮抗菌肽都是1条肽链。有些肽的个别氨基酸为D一氨基酸;有些肽在c端有酰胺化修饰;部分蛙皮抗菌肽含有2个半胱氨基残基,形成含有1个二硫键的分子.除Tigernin一1分子的二硫键包含9个氨基酸残基。Japonicin一2分子的二硫键包含8个氨基酸残基外,其余蛙皮抗菌肽分子的二硫键都只包含7个氨基酸残基。几乎所有的蛙皮抗菌肽分子都含有较多的亮氨酸和异亮氨酸残基,所以是疏水肽;同时也含有一些精氨酸和赖氨酸残基,因而是阳离子肽。绝大多数肽分子在水溶液中为无规则卷曲构象,在亲脂性溶液中(如50%的三氟乙醇溶液)或接触到平面双层时,多数氨基酸残基形成两亲a一螺旋,两亲a一螺旋可以用a一螺旋轮来表示[6“]。 本试验从中国林蛙皮肤中直接证实了蛙皮抗菌肽的存在。用RT—PcR的方法可以从直接得到大约4ng的蛙皮肤mRNA中,得到1条高清晰度的大约310bp的单链条带,在1%的琼脂糖凝胶电泳中可以得到证实。估计蛙的皮肤抗菌肽占蛙皮肤总蛋白的4%左右,另外,通过抑菌试验,利用内插法的二次回归模型在固相培养基上对浓缩的蛙皮肤抗菌肽进行活性检测,推测它也具有蛙皮抗菌肽的生物活性。总之。中国林蛙成熟的蛙皮抗菌肽cDNA序列已经确定,并且它的活性也已经证实。这个结果将对在外界压力下、病毒的感染或者在免疫刺激剂的影响下.抗菌肽基因的表达研究非常有价值。 648中国兽医学报2006年11月第26卷第6期cJIl砌£,y“SciNov.2006V01.26No.6 ence),1995,37:105—122.[J].BiopoIymes(Peptidescience),1998,47(6):415—433 [8]AndreuD,RiVasL.Animalantimicrobia
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