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高斯软件-基础教程 高斯软件-基础教程 PAGE / NUMPAGES 高斯软件-基础教程 GaussView界面教程【 1】——界面介绍 Gview 是一个专门设计于高斯配套使用的软件， 其主要用途有两个： 构建高斯的输入文件； 以图的 形式显示高斯计算的结果。除了可以自己构建输入文件外， Gview 还可读入 Chem3D， HyperChem 和晶体数据等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连用，大大拓宽了使用范围。 开启 GaussView会看到一大一小两个窗口，后面灰色背景的窗口为选择窗口，在里面选择要输入的分子或基团；前面紫色的窗口为绘图窗口，使用鼠标绘制想要绘制的图形。 精心整理 菜单栏 File 】主要功能是建立，打开，保存和打印当前的文件 Edit 】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等 View】与显示分子相关的都在这个菜单下，如显示氢原子、键、元素符号、坐 标等 Calculate 】直接向 Gaussian 提交计算 Results 】接收并显示 Gaussian 计算后的结果 Windows】控制窗体，如关闭、恢复等 Help 】帮助 快速工具栏 【左面第一个】选择元素与价键，单击打开会看到一个元素周期表，通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。 精心整理 【左面第二个】环工具，作用与上一个差不多，只是这里提供的都是环状化合物残基； 精心整理 【左面第三个】提供常用的 R基团模板，其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等 精心整理 【左面第四个】氨基酸残基，使用它可以迅速绘制氨基酸 【左面第五个】用户自定义基团，您可以将常用的基团存放到此处 这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】 | 【键角调整】 | 【二面角调整】 | 【查询已有结构】 | 【增加化学键】 | 【删除化学键】 | 【翻转原子】 | 【单个选择】 | 【框选】 | 【去除选择】 | 【全选】 这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。 精心整理 3、常用工具栏 这两条条工具栏是最常用的，几乎所有软件都有的新建打开等工具 GaussView教程【 2】——构建分子 这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从 GaussView 里递交计算为例来说明。 1、 开启 Gview 2、 双击 按钮，选择苯基（第一个），会看到主程序框体中出现苯环 精心整理 在工作窗口单击，可以看到工作窗口也出现了一个苯环。 单击左键，可以将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口； 按上下左右键，或者左键单击不放移动鼠标，可以调节分子的角度； 滚动鼠标滚轮，可以放大缩小分子； 按住 shift 键，左键单击不放移动鼠标，可以移动分子； 当工作窗口内有多个分子时（在构建大的分子时，这种情况很容易出现） 用 Shift+Alt+ 鼠标左键组合，移动想要移动的分子； 精心整理 用 Ctrl+Alt+ 鼠标左键组合调节其中一个分子的角度； 双击 图标（或者左键不放），在元素周期表中选择【 F】元素，回到工作窗口在苯的任意一个【H】上单击，使之变成【 F】 双击 图标，从链烃库中选择【乙基】（第一个），然后点击间位上的【 H】即可 精心整理 至此，分子式已经构建完成， Gview 存储个人常用分子的功能，双击 view 上的 图标，在下面 的对话框中键入相关项目，保存即可。 （注：我的程序此项功能不行，用户自定义基团） 精心整理 查看分子坐标：单击 Gview 界面的 图标，查看分子的坐标。 精心整理 至此，我们保存一下我们构建好的间氟苯乙烷分子，在绘图界面右键单击【 File 】——【 Save】 然后选择保存路径即可。 精心整理 GaussView教程【 3】——向 Gaussian 提交计算 上一讲我们已经构建好了一个间氟苯乙烷分子，现在打开间氟苯乙烷分子。 点击 Gview 界面上的【 Calculate 】——【 Gaussian Calculate Setup 】 精心整理 从对话框中我们可以选择许多参数，下面依次选择一下 精心整理 Job Type 】工作类型： Energy 能量】 | 【Optimization 优化】 | 【Frequency 频率】 | 【Opt+Freq 优化＋频率】 | 【Scan 扫描】 | 【Stability 稳定性】 | 【 NMR核磁】， 这里我们选择【 NMR】核磁 【Method】方法：每种计算模式都提供了若干种方法，这里选择默认值即可 Title 】题目：这项可以根据自己的项目自行命名 Link 0 】给检查点文件命名 其它选择默认即可 选好后点击【 Submit 】提交至 Gaussian ，并保存。（最好存到安装文件所在磁盘） 精心整理 系统会询问是否提交至 Gaussian，选择【 OK】，Gau