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- 2021-10-08 发布于天津
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Example of codeml analysis~Beginning guide~
Codeml 是PAML软件包下的一个程序,在估算蛋白编码序列 同义替换和非同义替换速率以及检测序列是否经受正选择 方面受到广泛的使用。
在本节中,我将简单描述一个例子来分析编码序列氨基酸 位点是否存在正选择作用。
简单流程
?議勰弩隸澡鬆韶豁勰使用的
软件包的安装
2.必需文件的准备
3.程序的运行与结果解释
PAML的安装
?软件下载:
ne.ucl.ac.uk/software/paml.html #dow nload
?最新PamIX或Paml4.7.以为例, 〔PamIX具有图形界面,
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