二生物信息学数据库及检索(共127张PPT).pptx

常用数据库简介第一页,共一百二十七页。数据库(Database) 用于收集、整理、储存、加工、发布和检索数据的系统。生物类的数据库种类很多投稿文章首先要将核苷酸序列或蛋白质序列提交到相应的数据库中第二页,共一百二十七页。 数据库记录通常包括两部分 原始数据 对这些数据进行的生物学意义的注释 一个数据库通常链接了多个相关数据库 核苷酸数据库-水稻抗病相关基因OsDR8 Taxonomy 数据库Pubmed 数据库NCBI-Protein 数据库第三页,共一百二十七页。(一)数据库工具 建立纯文本数据库 GenBank 数据库、EMBL 核苷酸数据库 MySQL 数据库工具 SQL(结构化查询语言)是世界上流行的和标准化的数据库语言能够快速灵活存储记录文件和图像下载 :///第四页,共一百二十七页。11G1810.42 L10440.84NBS1190.21RM2240.21R15060.00Xa261.47Y6855RA0.00S128860.63RM144 AceDB 数据库工具AceDB:A C. elegans DataBase(线虫数据库)被广泛应用的管理和提供基因组数据的工具数据形式丰富 遗传图谱物理图谱新陈代谢途径序列等1 gggctccacc actagtaccc ctcactacag gtagccataa aaaaaatcga tcaccaaaac 6

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