不足: 相对物种专一性; 因为开发时需针对每个座位微卫星序列, 发觉其两端单拷贝序列设计引物, 需建立基因文库、克隆识别与筛选、测序等过程, 开发困难, 费用较高, 耗时长; 实际分析时通常每次只分析单个位点; 不一样引物退火温度不一样, 需要探索。 *使用SSR技术前提是需要知道反复序列两翼DNA序列。 3.单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms , SNP) 等位基因遗传密码单碱基差异。基因组中每隔1000个碱基就存在一单碱基差异。通常经过对PCR产物、基因组文库、表示序列标签(EST)文库测序而取得。 特点: 数量大 分子标识类型及原理 1. 以分子杂交为基础DNA标识技术。限制性片段长度多态性(Restriction fragment length polymorphisms, RFLP), 可变数目串联反复序列(Variable number of tandem repeats, VNTR), 原位杂交(in situ hybridization, ISH) 2. 以PCR为关键分子标识技术。RAPD、SSR、STS。 3. 新型分子标识。SNP、Indel等。 原位杂交 PCR Melting 94 oC Melting 94
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