《兽医微生物学》第6章细菌的分类与命名.ppt

第一节 细菌的分类地位 第二节 细菌的命名 第三节 细菌分类鉴定的标准 第四节 细菌分类的方法 第五节 细菌的分类体系 第六节 细菌的鉴定 第6章细菌的分类与命名 Keywords ? family ? genus 科 属 ? species ? subspecies ? type ? subtype ? strain 种 亚种 型 亚型 菌株 第 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 一、生物的分类 ? 六界：动物界、植物界、真菌界、原 生生物界、原核生物界、病毒界。 ? 细菌分类层次与其他生物相同，即： 界、门、纲、目、科(Family)、属 (Genus)、种(Species)。 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第一节 细菌的分类地位 第 1. 属（Genus） （P70） 是具有共性的若干种的组合，应与 其他属有明显的差异。不同属之间 的16S rRNA序列有较大的差异（差 异应大于5%-7%）。 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第一节 细菌的分类地位 第 2. 种（Species) 生物分类的基本单位。凡属同种的 生物，均具有共同的基本性状特征。 它是生物在一定演化阶段，具有相 对稳定的一定性状特征的实体。 ? 16S rRNA序列同源性大于97% 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第一节 细菌的分类地位 第 3. 种以下的分类单位 (1) 亚种(subspecies)：种内可能存在一 些在某些性状上相互差异的类别。 (2) 型(type)与亚型(subtype)：仅仅是 某一方面的性状， 如血清型。型内还 可按进一步的性状差异区分为不同亚 型。 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第一节 细菌的分类地位 第 (3) 菌株(strain)：是指同种细菌中不 同来源的纯培养物。 ? 具有典型特征的菌株称为典型株/ 代表株/标准株。 ? 不同菌株可能性状完全相同，也可 能有某种微小差异。 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第一节 细菌的分类地位 第 ?“双名法”命名 （国际细菌命名法规） ?由属名和种名两部分组成。属名 （第一字母大写）在前，种名在后。 均用拉丁文或拉丁化的文字表示。 ?在出版物中，属名和种名均应排成 斜体。如Staphylococcus aureus ?翻译时，种名在前，属名在后。 第 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第二节 细菌的命名 ?未确定种名的细菌命名 ：在属名后 加上sp.或spp.（正体）。 ?新种的命名：在学名之后加注sp. nov. （novo species）（正体）。 ?亚种的命名：ssp. 或subsp.（正 体）。 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第二节 细菌的命名 第 一、细菌分类的指征 1. 形态学特性 2. 培养特性 3. 生活方式 4. 生理生化特性 5. 抗原构造 6. 对噬菌体的敏感性 7．对抗生素及其他化学物质的敏感性 8．病原性 9．遗传学特征 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第三节 细菌分类鉴定的标准 第 二、细菌种系发生关系的研究方法 1）DNA中G+C摩尔百分数(%)含量测定 ? （G+C）mol%含量：某一生物DNA中 的G+C配对碱基按摩尔数计算占全部碱 基的百分数（反映该生物遗传性状的一 种本质特征）。 ? 测定方法：梯度密度离心法、解链温度 法(Tm)等。 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第三节 细菌分类鉴定的标准 第 2）DNA或RNA同源性的测定 ? DNA-DNA杂交试验(hybridization) ?原理：同源DNA单链或非同源 DNA单链，只要它们彼此在核苷酸 序列上有相应互补的部分，就可产 生不同程度的结合。 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第三节 细菌分类鉴定的标准 第 2）DNA或RNA同源性的测定 ?应用：通过在体外测定菌株间DNA 的杂合率，据此推算出DNA的相似 程度，判断它们在亲缘关系上的亲 疏，帮助分类鉴定。 ? DNA-RNA杂交试验 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第三节 细菌分类鉴定的标准 第 3）rRNA的分析 ? rRNA在遗传信息传递中起重要作用， 特别是16S rRNA 能反映各种细菌间 在系统发生方面的关系。从该rRNA 的碱基序列可绘制系统发生树。 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第三节 细菌分类鉴定的标准 第 1. 数值分类法 2. 分子生物学分类法 3. 血清学方法 4. 化学分类法 六 章 细 菌 的 分 类 与 命 名 第四节