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实用 实用 文档 文档 第一章 蛋白质的结构与功能 氨基酸的两性解离与等电点 氨基酸的两性解离 氨基酸同时含有氨基和羧基, 是两性电解质,在水溶液以兼性离子或偶极离子的形式存 在。氨基酸的兼性离子在酸性溶液中可接受质子形成阳离子, 在碱性溶液中则释放质子形成 阴离子。 (2 )氨基酸的等电点 调节溶液的pH值,到某一点时羧基所带的负电荷与氨基所带的正电荷相同, 氨基酸表 现为整体不带电,这点的 pH值就是氨基酸的等电点。 蛋白质的结构层次 蛋白质是具有特定构象的大分子, 为研究方便,将蛋白质结构分为几个结构水平, 包括 一级结构、二级结构、三级结构和四级结构以及超二级结构结合域。 一级结构:氨基酸排列顺序,其维持键为肽键及二硫键。 二级结构:指蛋白质多肽链本身的折叠和盘绕方式。二级结构主要有a -螺旋、B -折叠、B - 转角。二级结构是通过骨架上的羰基和酰胺基团之间形成的氢键维持的, 氢键是稳定二级结 构的主要作用力。 三级结构:蛋白质分子处于它的天然折叠状态的三维构象。 三级结构是在二级结构的基础上 进一步盘绕、折叠形成的,三级结构主要是靠氨基酸侧链之间的疏水相互作用,氢键, 范德 华力和静电作用维持。 四级结构:在体内许多蛋白质含有两条或两条以上的多肽链, 才能全面执行功能。 每一条多 肽链都有其完整的三级结构,称为亚基,这种蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部 位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。其结合键为疏水键、离子键,氢键和范德华 力。 超二级结构和结构域 是介于二、三级结构之间的两个结构层次: 超二级结构是有规则的二级 结构聚合体,如 集合体等,而结构域是较大蛋白质中空间上可明显区分的相对独立的区 域性结构。 稳定蛋白质空间结构的作用力 维持蛋白质一级结构的化学键有肽键和二硫键; 维持二级结构靠氢键; 维持三级结构和 四级结构靠次级键,其中包括疏水建、氢键、盐碱和二硫键。 (1 )范德华力:非特异性相互作用,存在于所有分子及分子之间,在两个结构互补的大分 子间大量存在,介导酶与底物,抗原抗体结合力很弱。 (2 )氢键: 呈直线排列,是维持蛋白质构象的重要作用力。 (3 )离子键: 数量较少,主要在 R侧链间起作用。 (4 )疏水作用:是球状蛋白形成稳定构象的主要作用力。 (5 )二硫键: 分子量较大的蛋白多借二硫键稳固其结构。 二级结构的种类和特征 天然蛋白质的二级结构主要有三种类型:a -螺旋、B-折叠、B -转角 (一)a -螺旋的结构特点: (1 )蛋白质多肽链主链像螺旋状盘曲,每隔 3.6个氨基酸残基沿中心轴螺旋上升一圈,每 上升一圈相当于向上平移 0.54nm,即每个氨基酸残基向上升高 0.15nm,每个氨基酸残基 沿中心轴旋转100°。 (2 )a-螺旋的稳定性是靠链内氢键维持的,相邻的螺圈之间形成键内氢键,氢键的取向几 乎与中心轴平行,氢键是由每个氨基酸残基的肽链上所有的肽键都参与氢键的形成,因此, 乎与中心轴平行,氢键是由每个氨基酸残基的 肽链上所有的肽键都参与氢键的形成,因此,a (3)a-螺旋中氨基酸残基的侧链伸向外侧。a 白质a-螺旋,绝大多数都是右手螺旋。 3 -折叠的结构特点 N-H与前面隔3个氨基酸的C=O形成的, -螺旋相当稳定。 -螺旋有左手螺旋和右手螺旋两种,但天然蛋 (1 )3-折叠结构中两个氨基酸残基之间的轴心距为 0.35 nm (反式平行)及0.325nm (平 行式) (2 )肽链按层排列,靠键间氢键维持其结构的稳定性,3 -折叠结构的氢键是由相邻肽键主 链上的N-H和C=O之间形成的。 (3)相邻肽链走向可以平行也可以反平行, 肽链的N端在同侧为平行式,在不同侧为反平 行式,(即相邻肽链的N端一顺一倒地排列),从能量角度考虑,反平行式更稳定。 (4 )肽链中氨基酸残基的 R侧链交替分布在片层上下。 3-转角的结构特点 (1 )当蛋白质多肽链以180。回折时,这种回折部分就是3 -转角,它是由第一个氨基酸残基 的C=O与第四个氨基酸残基 N-H之间形成氢键,产生的一种不很稳定的环形结构。 由于3-转角结构,可使多肽链走向发生改变,目前发现的3 -转角多数都处于球状蛋白 质分子的表面,在这里改变多肽链的方向阻力比较小。 蛋白质一级结构与高级结构及功能的关系 蛋白质一级结构决定于高级结构,而高级结构决定功能。蛋白质天然构象一般是自由能 蛋白质一级结构决定于高级结构, 而高级结构决定功能。 蛋白质天然构象一般是自由能 对每种蛋白质而言, 有活性的最低的状态,蛋白质合成后要形成特定的立体结构才有活性, 对每种蛋白质而言, 有活性的 立体结构是特定的和唯一的, 称之为天然结构。蛋白质的天然立体机构在溶液中有一定的可 塑性。 牛胰RNAse变性,复性实验证明蛋白质的以一级

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