图位克隆原理.ppt

图位克隆原理简要说明;在拟南芥的众多生态型中最常用的三种是 Landsberg erecta(Ler) Columbia(Col) Wassilewskija(Ws) 其中Col生态型用于拟南芥的全基因组测序。;Marker;SSLP = simple sequence length polymorphisms 简单序列长度多态性 又称 SSR= simple sequence repeats 比较产物长度;CAPs = cleaved amplified polymorphic sequences 酶切扩增多态性 利用酶切位点;Marker: MIG5-B;dCAPs = derived CAPS 设计引物引入错配碱基，从而引入酶切位点;其它标记;SNP = single nucleotide polymorphism 单核苷酸多态性 主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所??起的DNA序列多态性。SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异，这种变异可由单个碱基的转换或颠换所引起，也可由碱基的插入或缺失所致。但通常所说的SNP并不包括后两种情况。(后面两种情况的多态性一般归为InDel） 密度： 每 3.3kb 存在一个 ;;;;;;F1;F1;F1 配子;F2 短根个体;wild type;只有左侧三种植株会选入定位群体;分子标记M5与突变位点的遗传距