高通量测序和肿瘤课题思路.pptVIP

NSCLC腺癌基因突变谱: 亚洲研究 EGFR仍然是亚裔腺癌最常见驱动基因 Koh Y, et al. 2013 ASCO Abstract 7572. Wu YL, et al. 2011. 370例中国肺腺癌 201例日本肺腺癌 驱动基因指导下NSCLC临床研究不停深入 Crizotinib 诊疗ROS1重排晚期NSCLC 33例ROS1阳性NSCLC患者入组, 31例接收crizotinib诊疗, 在25例疗效可评价患者中: ORR为56%, 8周和16周DCR为76%和60%。 中位PFS还未达成, 因为60%患者仍在随访中, 6个月PFS率为71%。 关键毒副作用是视觉障碍、恶心及腹泻。 结论: 即使该研究仍在继续, 但足以说明 crizotinib诊疗ROS1阳性NSCLC有效。 Sai-Hong Ignatius Ou,et al. 2013 ASCO Abstract 8032 基因多态性对药品作用影响 药代动力学 药效动力学 药物疗效和毒性的个体差异 基因多态性 药物靶点 药物转运体 药物代谢酶 因为个体差异存在。。。。 仅有20%~40%患者从已同意药品中获益; 70%~80%药品在临床试验中被淘汰; 很多已被同意药品因为毒副作用而退出市场。 G?T突变 野生型 突变型 基因多态性（SNP）在人群中普遍存在; 人类基因组平均每1200bp就有一个SNP。 不一样患者 相同癌症 相同临床分期 相同病理分级 影响因素 相同药品 相同计量 患者对药物反应正常 患者对药物不敏感 用药后产生毒副作用 癌症药品诊疗个体化 革命性测序技术发展 Sanger Sequencing 1977 Next-Generation Sequencing 2004 Ion Semiconductor Sequencing 2010 The Chip is the Machine 第一代测序 新一代测序 半导体芯片测序 第一代测序不足 操作繁琐, 测序时间长 一次只能对单个基因一个片段进行测序 样本需求量大（微克级） 背景噪音难克服, 难以确定低频突变 样本中肿瘤含量要求高 价格昂贵 新一代测序技术（next—generation sequencing） Roche 454, Genome Sequencer FLX ABI (Life) SOLiD 4 System Illumina/Solexa Hiseq 2000 第二代测序技术—高通量 高通量测序加速肿瘤个体化用药进程 一次能对多个基因多个片段进行测序 操作自动化, 测序时间短 样本需求量小（纳克级） 样本中肿瘤含量需求少 能够确定低频突变(~5%) 价格低廉 半导体芯片测序技术优点 简捷 光学－电子信号 快速 ２个小时完成测序 可扩展性 革命性突破 样本采集 血/组织/FFPE… 提取DNA /RNA 建 库 模板 制备 测序 /验证 Sh生物信息学分析 医学信息分析 汇报 生成 检测步骤— 缺一不可/个体化分析 深度分析 初步分析 药品 反应 疾病 风险 肿瘤 突变 三大支撑团体: 技术, 信息, 医学 石蜡包埋组织切片或组织块 新鲜冰冻组织 血液和骨髓 其他 检测步骤 文章如果有不当或者不妥的地方，请您联系我修改文章或者删除文章，文章来源于网络收集，如果有侵权的问题，请联系我沟通协调改正，非常感谢您！ 文章如果有不当或者不妥的地方，请您联系我修改文章或者删除文章，文章来源于网络收集，如果有侵权的问题，请联系我沟通协调改正，非常感谢您！ 文章如果有不当或者不妥的地方，请您联系我修改文章或者删除文章，文章来源于网络收集，如果有侵权的问题，请联系我沟通协调改正，非常感谢您！ 文章如果有不当或者不妥的地方，请您联系我修改文章或者删除文章，文章来源于网络收集，如果有侵权的问题，请联系我沟通协调改正，非常感谢您！ 文章如果有不当或者不妥的地方，请您联系我修改文章或者删除文章，文章来源于网络收集，如果有侵权的问题，请联系我沟通协调改正，非常感谢您！ 文章如果有不当或者不妥的地方，请您联系我修改文章或者删除文章，文章来源于网络收集，如果有侵权的问题，请联系我沟通协调改正，非常感谢您！ 文章如果有不当或者不妥的地方，请您联系我修改文章或者删除文章，文章来源于网络收集，如果有侵权的问题，请联系我沟通协调改正，非常感谢您！ 文章如果有不当或者不妥的地方，请您联系我修改文章或者删除文章，文章来源于网络收集，如果有侵权的问题，请联系我沟通协调改正，非常感谢您！ 文章如