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2022-04-14 发布于北京
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技术服务： / Tel ： / Web ：ht 上海市张江高科技园区李冰路 151 号（201203 ） ceRNA 研究技术路线一．数据分析流程：二．高级分析展示（部分）： ceRNA 调控分析近年来，一些研究显示circRNA 和lncRNA 可作为miRNA 的海绵吸附体，竞争靶向的 mRNA ，这类circRNA 和lncRNA 称为内源性竞争RNA （ceRNA ）。ceRNA 分析基于的表达值，通过回归模型分析以及序列匹配的方法，建立 microRNA 的海绵吸附作用的调控网络，找到的ceRNA ceRNA 调控网络: 伯豪生物注: 线代表不同的microRNA ，为mRNA ，红色为circRNA，绿色为lncRNA 技术服务： / Tel ： / Web ：ht 上海市张江高科技园区李冰路 151 号（201203 ） lncRNA 和mRNA 共表达分析共表达网络图（Coexpression Network ）是根据表达信号值的动态变化，计算间的共表达关系，得到间的表达调控关系及调控方向，从而构建的表达调控网络。通过研究 lncRNA 与mRNA 的共表达关系，研究者可通过分析lncRNA 调控能力，获得样本随实验变化的调控lncRNA 。伯豪生物 lncRNA 靶（cis，trans ）选取与 lncRNA 距离小于 10kb 的gene 作为 cis 作用的靶。Trans 采用数据库是物种对应的gene 序列数据库。参考文献： 1. Memczak S, Jens M, Elefsinioti A, Torti F, Krueger J, Rybak A, Maier L, Mackowiak SD, Gregersen LH, Munschauer M, Loewer A, Ziebold U, Landthaler M, Kocks C, le Noble F, 2 / 3 技术服务： / Tel ： / Web ：ht 上海市张江高科技园区李冰路 151 号（201203 ） Rajewsky N. Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency.Nature. 2013 Mar 21;495(7441):333-8. doi: 10.1038/nature11928. Epub 2013 Feb 27. 2. Hansen TB, Jensen TI, Clausen BH, Bramsen JB, Finsen B, Damgaard CK, Kjems J. Natural RNA circles function a