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TreePuzzle软件(TREE-PUZZLE)主要是基于核酸序列和蛋白序列,采用最大似然法(Maximumlikelihood)构建系统树。核酸序列建树时可使用模型有GTR、TN、HKY、F84、SH;蛋白序列建树时可选用模型有Dayhoff、JTT、mtREV24、BLOSUM62、VT、WAG。能在很短时间内快速构建出系统树,小编已为大家对比了该软件建树的系统树与PAUP软件构建的树是否有差别,结果表明二者建出的树完全一致。
TreePuzzle 软件构建系统发育树详细教程
原创作者:小飞鱼
TreePuzzle 软件 (TREE-PUZZLE )主要是基于核酸序列和蛋白序列,采用最大似然法
(Maximum likelihood )构建系统树。核酸序列建树时可使用的模型有GTR、TN 、HKY 、
F84 、SH;蛋白序列建树时可选用的模型有Dayhoff 、JTT 、mtREV24 、BLOSUM 62 、VT 、
WAG 。软件有Linux 、Mac、Windows 版本。能够在很短的时间内快速构建出系统树,小编
已为大家对比了该软件建树的系统
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