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- 2022-04-27 发布于北京
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核酸序列的获取与比对
尹富强
生命科学研究院
上机练习内容
1 从数据库获取核酸序列信息
2 序列搜索比对
3 多序列比对
3
1 从数据库获取
基因mRNA序列信息
4
以NCBI数据库为例
学习如何获取核酸序列及序列相关信息
genbank/
NCBI
GenBank
5
HomePage
6
HomePage
7
CCL21
8
Results
9
10
11
…
…
…
…
12
…
…
…
…
13
CCL21 mRNA 序列
CCL21 mRNA登录号
CCL21 编码蛋白CCL21登录号
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…
…
…
15
…………………………………………………………….
16
成功提取CCL21 mRNA全长序列
17
…………………………………………………………….
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编码序列
19
成功提取CCL21 mRNA编码序列
20
Advanced Search
21
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24
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2 序列搜索比对
26
NCBI主站点:
BLAST/
对一般用户来说,目前常用的办法是通过NCBI国际著名生物信息中心的BLAST服务器进行搜索。
序列比对神器-BLAST
27
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