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密码子、反密码子及 tRNA
密码子
1、定义
指信使 RNA上决定一个氨基酸的三个相邻碱基的排列顺序
2、特点
① 遗传密码子是三联体密码:一个密码子由信使核糖核酸(mRNA)上相邻
的三个碱基组成。
② 密码子具有通用性:不同的生物密码子基本相同,即共用一套密码子。
③ 遗传密码子无逗号:两个密码子间没有标点符号,密码子与密码子之间没
有任何不编码的核苷酸,读码必须按照一定的读码框架,从正确的起点开始,一
个不漏地一直读到终止信号。
④ 遗传密码子不重叠,在多核苷酸链上任何两个相邻的密码子不共用任何核
苷酸。
⑤ 密码子具有简并性:除了甲硫氨酸和色氨酸外,每一个氨基酸都至少有两
个密码子。这样可以在一定程度内,使氨基酸序列不会因为某一个碱基被意外替
换而导致氨基酸错误。
⑥ 密码子阅读与翻译具有一定的方向性:从5端到3端。
⑦有起始密码子和终止密码子,起始密码子有两种,一种是甲硫氨酸(AUG),
一种是缬氨酸(GUG),而终止密码子(有3个,分别是UAA、UAG、UGA)
没有相应的转运核糖核酸(tRNA)存在,只供释放因子识别来实现翻译的终止。
反密码子
1、定义
指转运 RNA上的一端的三个碱基排列顺序,转运 RNA一端携带氨基酸,另
一端反密码子与信使 RNA上的密码子(碱基)配对。
2、特点
反密码子的摆动配对
最初人们认为每一个密码子都有特异的tRNA反密码子。如果这种假说是正
确的,生物体中应该有至少61种不同的tRNA ,可能还有另外3种对应于链终
止密码子。然而有证据表明:某种高度纯化的已知序列的tRNA可以识别几种不
同的密码子。也有研究发现反密码子除了4种常规的碱基之外,还有第5种碱
基次黄嘌呤(inosine ,I)。和其他tRNA中的次要碱基一样,次黄嘌呤是通过对
完整tRNA链中的碱基进行酶修饰而得来的。次黄嘌呤源于腺嘌呤,即腺嘌呤分
子上第6个碳原子脱去氨基,成为次黄嘌呤的6一酮基基团。[实际上,次黄嘌
呤是由核糖和次黄嘌呤(hypoxanthine)碱基组成的核苷酸,但现已常常用来指
碱基,就如同我们这里所用的。
1966 年FrancisCrick 提出了摆动理论(wobbleconcept)来解释所观察到的
现象。摆动理论指
出,反密码子5’端的碱基在空间上不如其他2个位置上的碱基那么受限制,可
以和密码子3’端的几种碱基形成氢键。不是所有组合都行,配对局限于下表中
的碱基。例如,位于摆动位置的U可以和A或G配对,I可以和U、C或A配
对。摆动规则所允许的配对是那些核糖与核糖之间的距离与标准的A :U或G:C
碱基对相似的配对。(除了I和A碱基对)嘌呤与嘌呤、嘧啶与嘧啶的配对分别
使核糖与核糖之间的距离过长或者过短。
tRNA
1、定义
转运 RNA(transferribonucleicacid tRNA )是具有携带并转运氨基酸功
能的一类小分子核糖核酸,是Transfer_RNA的简称。大多数tRNA 由七十几至
九十几个核苷酸组成,分子量为25000~30000,沉降常数约为4S(个别tRNA
的沉降常数为3S ,含63个核苷酸)。tRNA分子均可排布成三叶草模型的二级
结构。
2、结构
①5端磷酸。
②受体臂(acceptstem ,也被称作aminoacidstem )是一个7
个碱基长的臂,其中包含5端,与有3端羟基(OH)(能结合氨基酸
于其上)的3端。受体臂有可能含有非Watson-Crick所发现的碱基对。
③CCA尾(CCAtai )是tRNA分子3端的CCA序列,在翻译时,
帮助酶识别tRNA。
④D 臂(Darm )是在一个环(Dloop )的端部4个碱基的臂,通
常含有二氢尿嘧啶(dihydrouridine)。
⑤反密码子臂(anticodonarm )有5个碱基,包括反密码子
(anticodon)。每一tRNA包括一个特异的三联反密码子序列,能够
与氨基酸的一个或者多个密码子匹配。例如赖氨酸(lysine)的密码子
之一是AAA ,相应的tRNA的反密码子可能是UUU(一些反密码子可
以与多于一个的密码子匹配被称为“摆动”)。
⑥T臂(Tarm )是5个碱基的茎,包括序列TψC。
⑦修饰碱基(Modifiedbases )是tRNA中的一些不常见的碱基,
如腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶的修饰形式。
3、功能
主要是携带氨基酸进入核糖体,在mRN
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