密码子 反密码子及tRNA.pdfVIP

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密码子、反密码子及 tRNA 密码子 1、定义 指信使 RNA上决定一个氨基酸的三个相邻碱基的排列顺序 2、特点 ① 遗传密码子是三联体密码:一个密码子由信使核糖核酸(mRNA)上相邻 的三个碱基组成。 ② 密码子具有通用性:不同的生物密码子基本相同,即共用一套密码子。 ③ 遗传密码子无逗号:两个密码子间没有标点符号,密码子与密码子之间没 有任何不编码的核苷酸,读码必须按照一定的读码框架,从正确的起点开始,一 个不漏地一直读到终止信号。 ④ 遗传密码子不重叠,在多核苷酸链上任何两个相邻的密码子不共用任何核 苷酸。 ⑤ 密码子具有简并性:除了甲硫氨酸和色氨酸外,每一个氨基酸都至少有两 个密码子。这样可以在一定程度内,使氨基酸序列不会因为某一个碱基被意外替 换而导致氨基酸错误。 ⑥ 密码子阅读与翻译具有一定的方向性:从5端到3端。 ⑦有起始密码子和终止密码子,起始密码子有两种,一种是甲硫氨酸(AUG), 一种是缬氨酸(GUG),而终止密码子(有3个,分别是UAA、UAG、UGA) 没有相应的转运核糖核酸(tRNA)存在,只供释放因子识别来实现翻译的终止。 反密码子 1、定义 指转运 RNA上的一端的三个碱基排列顺序,转运 RNA一端携带氨基酸,另 一端反密码子与信使 RNA上的密码子(碱基)配对。 2、特点 反密码子的摆动配对 最初人们认为每一个密码子都有特异的tRNA反密码子。如果这种假说是正 确的,生物体中应该有至少61种不同的tRNA ,可能还有另外3种对应于链终 止密码子。然而有证据表明:某种高度纯化的已知序列的tRNA可以识别几种不 同的密码子。也有研究发现反密码子除了4种常规的碱基之外,还有第5种碱 基次黄嘌呤(inosine ,I)。和其他tRNA中的次要碱基一样,次黄嘌呤是通过对 完整tRNA链中的碱基进行酶修饰而得来的。次黄嘌呤源于腺嘌呤,即腺嘌呤分 子上第6个碳原子脱去氨基,成为次黄嘌呤的6一酮基基团。[实际上,次黄嘌 呤是由核糖和次黄嘌呤(hypoxanthine)碱基组成的核苷酸,但现已常常用来指 碱基,就如同我们这里所用的。 1966 年FrancisCrick 提出了摆动理论(wobbleconcept)来解释所观察到的 现象。摆动理论指 出,反密码子5’端的碱基在空间上不如其他2个位置上的碱基那么受限制,可 以和密码子3’端的几种碱基形成氢键。不是所有组合都行,配对局限于下表中 的碱基。例如,位于摆动位置的U可以和A或G配对,I可以和U、C或A配 对。摆动规则所允许的配对是那些核糖与核糖之间的距离与标准的A :U或G:C 碱基对相似的配对。(除了I和A碱基对)嘌呤与嘌呤、嘧啶与嘧啶的配对分别 使核糖与核糖之间的距离过长或者过短。 tRNA 1、定义 转运 RNA(transferribonucleicacid tRNA )是具有携带并转运氨基酸功 能的一类小分子核糖核酸,是Transfer_RNA的简称。大多数tRNA 由七十几至 九十几个核苷酸组成,分子量为25000~30000,沉降常数约为4S(个别tRNA 的沉降常数为3S ,含63个核苷酸)。tRNA分子均可排布成三叶草模型的二级 结构。 2、结构 ①5端磷酸。 ②受体臂(acceptstem ,也被称作aminoacidstem )是一个7 个碱基长的臂,其中包含5端,与有3端羟基(OH)(能结合氨基酸 于其上)的3端。受体臂有可能含有非Watson-Crick所发现的碱基对。 ③CCA尾(CCAtai )是tRNA分子3端的CCA序列,在翻译时, 帮助酶识别tRNA。 ④D 臂(Darm )是在一个环(Dloop )的端部4个碱基的臂,通 常含有二氢尿嘧啶(dihydrouridine)。 ⑤反密码子臂(anticodonarm )有5个碱基,包括反密码子 (anticodon)。每一tRNA包括一个特异的三联反密码子序列,能够 与氨基酸的一个或者多个密码子匹配。例如赖氨酸(lysine)的密码子 之一是AAA ,相应的tRNA的反密码子可能是UUU(一些反密码子可 以与多于一个的密码子匹配被称为“摆动”)。 ⑥T臂(Tarm )是5个碱基的茎,包括序列TψC。 ⑦修饰碱基(Modifiedbases )是tRNA中的一些不常见的碱基, 如腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶的修饰形式。 3、功能 主要是携带氨基酸进入核糖体,在mRN

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