第八章 基因注释与功能分类.pdfVIP

第 一 节 引 言 背景 随着后基因组(post-genomics) 时代的来临 ， 基因组学的研究 重心开始从阐明所有遗传信息转移到在整体分子水平对功能进行 研 究 。 这 种 转 变 的 一 个 重 要 标 志 是 产 生 了 功 能 基 因 组 学 ( functional genomics ) 。 任务 功 能 基 因 组 学 的 主 要 任 务 之 一 是 进 行 基 因 组 功 能 注 释 ( genome annotation ) ， 了解基因的功能，认识基因与疾病的关 系 ，掌握基因的产物及其在生命活动中的作用等。 意义 快速有效的基因注释对进一步识别基因 ，研究基因的表达调 控机制 ， 研究基因在生物体代谢途径中的地位 ， 分析基因 、 基因 产物之间的相互作用关系 ， 预测和发现蛋白质功能，揭示生命的 起源和进化等具有重要的意义。 第二节基因注释数据库 Gene Annotation Database 基因注释数据库产生的原因 一、 研究人员已经掌握了大量的全基因组数据， 同时关 于基因 、基因产物以及生物学通路的数据也越来越多 ， 解释 生物学实验的结果， 尤其从基因组角度， 需要系统的方法。 二、 在基因组范围内描述蛋白质功能十分复杂，最好的 工具就是计算机程序，提供结构化的标准的生物学模型 ，以便 计算机程序进行分析，成为从整体水平系统研究基因及其产物 的一项基本需求。 、基因本体 gene ontology GO ) （ , 数据库 GO组织 Gene Ontology Consortium ) 基因本体数据库是 （ 在2000年构建的一个结构化的标准生物学模型 ， 旨在建立基因 及其产物知识的标准词汇体系 ， 涵盖了基因的细胞组分 ( cellular component ) 、 分子功能 ( molecular function ) 、 biological process ) 生物学过程 （ 。 Search the Gene Onto/osy gene or protein name Open menus Welcome to the Gene Ontology website! FAQ Downloads The Gene Ontology project Is a major bioin