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- 2022-06-27 发布于江苏
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arlequin 的使用说明
Arlequin3.1 的使用说明
Arlequin 功能的概述
Molecular diversity—分子多态性
Mismatch distribution—错配分布
Haplotype frequency estimation—单倍型频率估计
Linkage disequilibrium—连锁不平衡:检测不同位点上等位基因的非随机关
联
Hardy-Weinberg equilibrium—哈温—伯格平衡
Tajima’s neutrality test—Tajima 中性检测
Fu’ s neutrality test—Fu 中性检测
Ewens-watterson neutrality test—Ewens-watterson 中性检测
以上三个中性检测都是基于无限位点模型,适用于DNA sequence 和 RFLP 单倍
型。
Chakraboety’s amalgamation test—Chakraboety’s 融合检测,检测人群的
均一性和同质性,和中性选择等。
Minimu Spanning Network(MSN,最小扩张树或称之为最小支撑树,给予分子
差异。
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