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随着合成生物学与生物信息技术的迅猛发展,促成了生命密码从对自然的探索到人工合成的质变[1],使得人工分子的设计与合成生物系统的构建成为了可能。近年来人工合成的生物分子序列,例如药物小分子、DNA调控元件、蛋白质分子等,在医疗[2-4]、化工[5-6]、农业[7]等领域有着广泛的应用[8]。早期的生物序列设计手段主要聚焦于对天然序列进行随机突变[9-10]或者基于功能模块的组合进行筛选[11-12],存在一定的局限性:一方面,潜在的序列随着序列长度的增加构成了一个指数增长的空间。以DNA调控序列为例,仅100个碱基长度的DNA序列的潜在的碱基组合达到了4100,即存在约1060种潜在的待测序列,
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