《蛋白质组学》课程教学大纲（本科）.docVIP

PAGE1 / NUMPAGES4 蛋白质组学 （Proteomics） 课程代码： 学分：2 学时：32 （其中：课堂教学学时： 48 实验学时：24） 先修课程：生物化学、分子生物学、生化分离技术 适用专业：生物技术、生物工程、制药工程 教材：《蛋白质组学》， 江松敏 等编，军事医学科学出版社，2010 一、课程性质与课程目标 （一）课程性质（需说明课程对人才培养方面的贡献） 蛋白质组学是后基因组学时代发展起来的一门基于高通量、大规模分离、鉴定蛋白质，在组学水平解析生命活动现象的一门科学，是生物科学、生物技术及相关专业的一门专业选修课程。 （二）课程目标 本课程着重介绍蛋白质组学的基本原理和研究方法，通过本课程的学习，使学生了解并掌握生物体内蛋白质大规模分离、鉴定以及蛋白质间相互作用的研究手段和实验方法。 1、知识目标 1）掌握蛋白质组学的基本概念、诞生背景、和其他学科的关联； 2）理解并掌握蛋白质组学研究中样品收集、细胞破碎、蛋白质提取的基本原理和方法； 3）理解并掌握蛋白质二维电泳分离、图谱分析的基本原理和方法； 4）理解并掌握蛋白质生物质谱鉴定方法的基本原理； 5）理解并掌握蛋白质翻译后修饰、蛋白质相互作用研究方法的基本原理； 6）了解蛋白质组学研究方法及蛋白质组学在生命科学研究中的最新动态进展。 2、能力目标 1）具备开展蛋白质二维电泳分离、质谱分析鉴定的能力； 2）具备对生命活动现象在分子水平进行初步解释的能力； 3）具备较强的专业英语阅读能力和自主学习意识。 二、课程内容与教学要求（按章撰写） 第一章 绪论 （一）课程内容 （1）蛋白质组学的概念 (Definition of proteomics) （2）蛋白质组学与基因组学的联系与区别 (Relationship between proteomics and genomics) （3）蛋白质组学的研究现状和发展趋势 (Current progress and future of proteomics) （二）教学要求 （1）重点掌握蛋白质组、蛋白质组学的概念、学科诞生的背景和发展前景； （2）重点理解并掌握蛋白质组与基因组之间的关系； 第二章 蛋白质的提取 (Protein extraction) （一）课程内容 （1）细胞裂解的方法 (Methods in cell lysis) （2）蛋白质的分步提取技术 (Sequential extraction of protein) （3）细胞器的分离与蛋白质提取 (Cell fraction and organelle isolation) （二）教学要求 （1）重点掌握常见的细胞破碎、蛋白质提取的方法及其原理； （2）重点理解并掌握蛋白质样品制备在蛋白质组学研究中的重要地位。 第三章 蛋白质的分离 (Protein separation) （一）课程内容 1．教学内容 （1）一维等电聚焦电泳 (The 1st dimensional iso-electronic focusing) （2）二维SDS—聚丙烯酰胺凝胶电泳 (The 2nd sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis) （3）胶上蛋白的检测 (Protein spots visualization) （4）存在问题与解决方案 (existing problems and possible solutions) （二）教学要求 （1）重点掌握蛋白质双向电泳分离的原理和方法（本章重点和难点）； （2）重点掌握蛋白质电泳后的染色技术。 第四章 图像分析与蛋白表达谱数据库 (Image analysis and 2-DE database) （一）课程内容 （1）蛋白电泳图像分析系统 (Image analysis system) （2）实用软件简介 (Image analysis software) （3）二维电泳蛋白谱数据库 (2-DE database) （二）教学要求 （1）重点了解和掌握二维电泳图谱的分析软件和基本数据库的应用。 第五章 蛋白质的鉴定 (Methods in protein identification) （一）课程内容 （1）生物质谱概述 (Basic principles of biological mass spectrometry) （2）基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (Matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry) （3）液相色谱—电