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【盘点】代谢组学中常 5 大分析方法，你知道几个？ 代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思 代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思 想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究。代谢组学的研究需要高灵敏度、高通量且稳定性好的方法，所以检测平台的选择也是至关重要，今天小析姐就和大家聊一聊代谢组学和代谢组学的研究检测技术。 我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担，而上游的（核酸、蛋白质等）大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面，如神经递质的变 化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等，所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息。如同我们在长江的上游建大坝或对江水改道，这些项目的生态影响会在下 游的河道和地域体现出来一样， 我们经常说，基因组学和蛋白组学告诉你可能发生什么，而代谢组学则告诉你已经发生了什么。 什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（ Metabonomics/Metabolomics ）是 20 世纪 90 年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动 后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢 物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究 的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及 其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。 代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来 反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。 代谢组学的研究对象与层次有哪些？ 一般来说，代谢组学关注的对象是分子量在 1000 以下的小分子化合物。根据研究的对象和目的不同，科学家将生物体系的代谢产物分析分为 4 个层次： 代谢物靶标分析： 某一个或几个特定组分的定性和定量分析，如某一类结构、性质相关的化合物（氨基酸、有机酸、顺二醇类）或者某一代谢途径的所有中间产物或多条代谢途径的标志性组分。 代谢物指纹分析： 同时对多个代谢物进行分析，不分离鉴定具体单一组分。 代谢轮廓分析： 限定条件下对生物体内特定组织内的代谢产物的快速定性和半定量分析。 代谢组分析： 对生物体或体内某一特定组织所包含的所有代谢物的定量分析，并研究该代谢物组在外界干预或病理生理条件下的动态变化规律。 代谢组学可以检测的样品种类有哪些？ 代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物（分子量 1000 ）。其样品主要是血浆或血清， 尿液，唾液，以及细胞和组织的提取液。 一般代谢组学能检测出多少物质？ 不同的质谱平台灵敏度及偏向性都不一样，而且不同平台之 间具有互补性。 一般来说 GC/MS 检测血清样品能准确定性的物质约 200 个左右，检测尿液样品定性的物质约 200 个左右，其他样品（如肝脏，粪便，肠道内容物）也在几百这个 数量级。如果采用全二维 数量级。如果采用全二维 GC/MS ，物质的数量要更多，可 达 1 千以上。 LC/MS 检测物质的数量要远比 GC/MS 多，但能准确定性和定量的不多，视不同的平台 (TQ 、QTOF 等)能达到几十至 2-3 百个物质。 代谢组学中的技术概述1、如何获得有效、可靠的代谢组学数据 代谢组学中的技术概述 1、如何获得有效、可靠的代谢组学数据 选用高灵敏度和高选择性以及能够检测大多数代谢物的技术； 在给定的生物样品中，能够提供高度可重复性且低成本。 目前没有一种分析工具具备上述所有特征，但目前应用最广 泛的代谢组学方法： 核磁共振波谱（ NMR ）和质谱（ MS） 与气相色谱（ GC）、液相色谱、（ LC）或毛细管电泳 （CE）联用。 然而，这些分析平台都不能单独提供生物样品中整个代谢组的全面鉴定和量化，因为每种不同技术都有一系列优缺点。 2 2、非靶向代谢谱分析 核磁共振波谱（ NMR ）应用于代谢组学，采用的是非靶向的方法，关注的是整体全局的代谢情况。非靶向代谢谱分析目 的：通常用于鉴定和相对量化代谢物，这些代谢物依据分 类，具有不同的功能。 这种方法通常与生物标记物的发现、诊断和与疾病病理生理学相关假说的产生有关。 优点： 不必事先知道给定生物样品的代谢物种类； 缺点： 只对代谢物进行半定量，没有适当注释下，就识别出显著的峰，使深层机理和生化的理解复杂化。 代谢物注释是确定代谢物结构和功能的过程，代谢物识别能力的局限性一直是代谢物组学研究的主要障碍之一。 3 3、靶向代谢谱分析 质谱（ MS）常被用于靶向代谢组学研究，重点是精确定量和鉴定一组特定的已知代谢产物。 靶向代谢谱分析的目的： 确定并对感兴趣的代谢物进行绝对定量分析，这是通过光谱匹配到真实的参考化合物来实现 的，该参考化合物通常作