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LAMMPS手册-中文解析 一、简介 本部分大至介绍了LAMMPS的一些功能和缺陷。 1．什么是LAMMPS? LAMMPS是一个经典的分子动力学代码，他可以模拟液体中的粒子，固体 和汽体的系综。他可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子，聚合物，生物，金属，粒状和粗料化体系。LAMMPS可以计算的体系小至几个粒子，大到上百万甚至是上亿个粒子。 LAMMPS可以在单个办理器的台式机和笔记本本上运行且有较高的计算效 率，但是它是特意为并行计算机设计的。他可以在任何一个按装了C++编译器和 MPI的平台上运算，这其中自然包括散布式和共享式并行机和Beowulf型的集群 机。 LAMMPS是一可以更正和扩展的计算程序，比方，可以加上一些新的力场，原子模型，边界条件和诊断功能等。 平时意义上来讲，LAMMPS是根据不同的边界条件和初始条件对通很短程和长程力相互作用的分子，原子和宏观粒子会集对它们的牛顿运动方程进行积分。高效率计算的LAMMPS经过采用相邻清单来追踪他们周边的粒子。这些清单是根据粒子间的短程互拆力的大小进行优化过的，目的是防备局部粒子密度过高。在并行机上，LAMMPS采用的是空间分解技术来分配模拟的地域，把整个模拟空间分成较小的三维小空间，其中每一个小空间可以分配在一个办理器 上。各个办理器之间相互通信并且存储每一个小空间边界上的”ghost原”子的信息。LAMMPS(并行