第五章--近交系数与亲缘相关系数.docxVIP

PDF 文件使用 pdfFactory Pro 试用版本创建 PDF 文件使用 pdfFactory Pro 试用版本创建 第五章 近交系数与亲缘相关系数 一个延续繁殖了若干代的畜群，无论这个群体有多大，无论何种交配方式，个体之间都必然会存在程度不同的亲缘关系。虽然一个个体从两性亲本那里得到来源不同的基因，但如果双亲的上几代中有共同的祖先，那末这个个体从父母那里得到的基因中，就会有来自那个共同祖先的基因。法国的数学家和群体遗传学家 Malécot(1948)把一个个体的两个相同基因来自同一祖先的概率，称为这个个体的近交系数。在此之前，美国遗传学家 Wright(1921,1922)利用通径系数理论，也提出了近交系数的概念及其具体算法，至今仍在广泛的应用。他把一个个体的近交系数定义为：某一个体的近交系数，是产生这个个体的两个配子之间的相关系数。这两种说法的着眼点不同，一个是以等位基因为基础，而另一个则着眼于配子。前者解释了近交的遗传上的原因，较易于理解；而后者则提供了求近交系数的具体算法，更易于应用。这两种方法都要求从待测近交系数的个体的父母开始，一直追溯到最远的所有共同祖先。 在数量性状遗传规律的研究中，分析个体或群体的近交程度，无论在理论上还是实践中， 都有很重要的意义。对于质量性状来说，近交的结果是，既能纯合对人类或动物本身有利的基因，也能纯合对人类无益或对动物本身有害的基因。对于数量性状来说，近交也有类似的情况。一个近交个体从共同祖先那里得到的一对同源等位基因，对某个数量性状来说，可能是增效基因，也可能是减效基因，前者使个体的表型值和育种值得到提高，后者使表型值和育种值降低。一个生产性能卓越的共同祖先，通过近交能使一些高产基因集中于其所生的后代，而后代在繁殖过程中，又能把这些高产基因继续扩散到整个畜群中，从而达到提高生产性能和改进品质的目的。因此，研究个体的近交程度，估计个体的近交系数是十分必要的。 第一节 个体的近交系数 父母代与子代之间是明显的因果关系，前面已经证明了一个亲本到子女的通径系数是 1/2。一个近交个体的父母，可以看成是两个结果，而它们的共同祖先则可看成是共同原因。于是， 两个结果间的相关系数就等于连接两个结果的各个通径系数的乘积，父亲到共同祖先的代数用 n1 表示，母亲到共同祖先的代数用 n2 表示，则两个结果之间通径系数的乘积为（?）n1+n2。 当有两个以上共同原因时，则父母之间的相关系数，等于连接两者的通径系数的乘积之和， 即??1 2?n1 ?n2 。又由于子代从父母那里各得一半的基因，所以父母的同源基因也只有一半传 给子代，因而构成子代的两个配子间的相关系数即近交系数，等于父母之间相关系数的一半， 1 ? 1 ?n1 ? n2 Fx ? 2 ?? 2 ? ? ? 当共同祖先也是近交所生时，该共同祖先的近交系数也应考虑进去。这时近交系数的公式 应为： ? 1 ?? ? 1 ??1 2?n ?n x 2 ?1 ? FA ? 32 其中，FA 为共同祖先的近交系数。显然，上式求和符号? 之前的 1/2，也可以放在? 之后， 即 Fx ? ??1 2? ?1 ? F ? An1 ?n2 ?1 A 如果把 n1+n2 写成 n，则上式也可写成： xAF ? ??1 2?n?1 ?1 ? F ? x A 共同祖先无近交系数 例 1：求个体 x 的近交系数 FX. 解：x 只有一个共同祖先 A。所以，  S B C 1 ? 1 ?n1 ?n2 X A Fx ? 2 ?? 2 ? ?1 ? FA ? ? ? D H 1 ? 1 ?3?2 ? ? ? ? ?1 ? 0? 2 ? 2 ? ? 1 ?6 ? ? ? ? 2 ? ? 0.015625 KNMLO例 2：求个体 x 的近交系数 K N M L O 解：K 与 L 有两个共同祖先 M 和 S， 所以， X S xAF ? ??1 2?n1 ?n2 ?1 ?1 ? F ? x A ? ?1 2?1?1?1 ? ?1 2?2?2?1 ? 1 ?3 ? 1 ?5 A1A2BM1C1GM2C2S A1 A2 B M1 C1 G M2 C2 S D X ? 2 ? ? 2 ? ? 0.125 ? 0.03125 ? 0.15625 例 3：求个体 x 的近交系数 Fx。 连接 S 与 D 的通径链有两条，通过 A2 连接解：S 和 D 有两个共同祖先 A1 和 A 连接 S 与 D 的通径链有两条，通过 A2 连接 所以，x 的近交系数 Fx 为： ? 1 ?3?3?1 ? 1 ?3?3?1 ? 1 ?2?1?1 ? 1 ?1?2?1 Fx ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? 2