《基因组学》第06章 基因组解剖.pptVIP

线虫操纵子的组成 1) 线虫基因组约含900操纵子, 15%的基因(2600个)位于操纵子中.每个操纵子平均含2.6个基因. 2) 已知线虫最大的操纵子含8个基因. 3) 线虫操纵子主要位于常染色体低重组区, X染色体和染色体端部很少操纵子. 被RNAi干扰的基因也大多位于这些区域. 4) 操纵子基因之间的间距约100 bp, 比细菌的长,主要便于反式剪接因子的结合. 5) 线虫操纵子中的基因类型不是随机的, 大多数操纵子基因主要涉及基础性和普遍性的生物学功能, 很少包括组织专一性表达及调控的基因. 线 虫 操 纵 子 线虫操纵子的结构与分布 锥虫(磕睡虫)的多顺反子结构基因 1) 锥虫(Trypanosomatidae)基因组中绝大多数基因均以顺反子结构排列, 因此基因组中只有极少数的启动子(已知的如VSG基因 , rRNA基因, tubulin 基因和PARP 基因). 2) 锥虫所有编码mRNA的基因均以反式剪接方式加工, 因此每个顺反子加工后5’-端均有一段被加上的39 nt的反式剪接引导顺序, 它们来自一个100 nt的SL (splicing leader)mRNA前体. 3) SL基因以头尾串接方式重复排列. 注: 反式剪接的机制见第8章, RNA的加工. 基因组转座子 1) DNA转座子 2) 逆转录转座