上海海洋大学分子生态学课件-15分子生态学+量化种群的分化.pptVIP

第二节 量化种群的分化一、遗传距离衡量两个种群的遗传相似性的方法之一是估计种群间的遗传距离，最常用的方法是Nei（1972）标准遗传距离D。计算D值，首先需要了解遗传同一性衡量指标（I），该指标反映了种群间的遗传相似性。对于任意位点，遗传同一性可以表示为：其中，Pix是等位基因i在种群x中的频率，Piy是等位基因i在种群y中的频率，m是该等位基因数目。I的取值范围从0到1。 ? (P2iy)]0.5mi=1? (PixPiy)mi=1[? (P2ix)(mi=1I= 第二节 量化种群的分化一、遗传距离根据I值，按照下列公式即可计算遗传距离D： D=-lnI如果两个种群有相似的等位基因频率，即Pix≈Piy，则两个种群的遗传相似性I将趋近于1，而遗传距离D将趋近于0；如果两个种群没有任何共有的等位基因，则I为0，D趋近于无穷大。二、F-统计量量化种群间遗传分化最常用的方法是F-统计量Wright（1951），该指标用近交系数来描述遗传变异在种群内和种群间的分配。F-统计量可以在三个不同的水平进行计算，包括种群内、种群间和整个种群近交的数量。描述这些水平时，习惯上把空间分离的样本称为亚种群。 第二节 量化种群的分化二、F-统计量1. FIS