上海海洋大学分子生态学课件-19分子生态学+谱系地理学.pptVIP

第一节 什么是谱系地理学谱系地理学(Phylogeography)研究支配种内和近源种间遗传谱系的地理分布的原理和过程，其研究目的是了解历史事件在等位基因、种群和物种形成现有的地理分布格局过程中所起的作用。谱系地理学同时关注遗传变异在时间（进化关系）和空间（地理分布）上的分布状态，通过对比遗传谱系的进化关系与地理位置来更好地理解影响遗传变异分布的因素。 第二节 谱系地理学中的分子标记一、细胞器与细胞核标记1. 谱系地理学中常用的细胞器标记谱系地理学研究的理想标记是线粒体或叶绿体基因组，近二十年来谱系地理学研究中的绝大部分是利用它们完成的。（1）细胞器基因组标记的优点a. 易于操作；b.动物线粒体DNA相对较高的突变率以及假定缺少重组（动物线粒体）或重组率低（植物叶绿体）而导致有效的克隆遗传等；c.现成的动物线粒体通用引物以及不断开发的植物叶绿体通用引物促进了相关研究的开展。 第二节 谱系地理学中的分子标记一、细胞器与细胞核标记1. 谱系地理学中常用的细胞器标记（2）细胞器基因组标记的局限性a. 只包含有效的单个基因位点，若该位点受到选择、杂交或其他一些使其经历异常历史过程的影响，那么基于这个基因位点重建种群的历史就不是一个理想的选择；b. 细胞器基因组对于瓶颈效应的敏感性并不总是有利的，而且如果雄性和雌性或种子和花粉分别具有不同的传播模式，细胞器基因组的单亲遗传模式可能会导致其