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统计分析流程： Hardy-Weinberg Equilibrium Test(遗传平衡检验) 连锁不平衡分析 等位基因频率、相关等位基因阳性个体频率的单因素分析(卡方检验) HLA-A，HLA-B，HLA-DRB1等位基因频率与其它汉族人研究样本相应位点等位基因频率的比较 多因素分析(Logistic回归) 单倍型分析 统计软件：Cervus, GenePop，SAS 8.1e HLA复合体多态性与HBV 持续感染的关系研究 第三十页，共五十二页，2022年，8月28日 HLA复合体多态性与HBV 持续感染的关系研究 参照人群 样本一：中国南方汉族人 (2n=564) (HLA I) 样本二：新加坡汉族人 (2n=298) (HLA I) 样本三：香港汉族人 (2n=1141 of 1144) (HLA I) 样本四：武汉汉族人：2n=240 of 242 (HLA II) 第三十一页，共五十二页，2022年，8月28日 基因组DNA质控： -308G/A HLA复合体多态性与HBV 持续感染的关系研究 第三十二页，共五十二页，2022年，8月28日 HLA测序分型的策略 HLA-A,B Sequencing-Based Typing 第三十三页，共五十二页，2022年，8月28日 HLA测序分型的策略 HLA-DRB Sequencing-Based Typing 第三十四页，共五十二页，2022年，8月28日 华大基因HLA测序分型结果： HLA复合体多态性与HBV 持续感染的关系研究 第三十五页，共五十二页，2022年，8月28日 HLA复合体多态性与HBV 持续感染的关系研究 华大基因HLA测序分型结果： HLA-DRB1*12021/1302 第三十六页，共五十二页，2022年，8月28日 HLA复合体多态性与HBV 持续感染的关系研究 数据格式 Allele 1 Allele 2 Allele 3 Allele 4 … Allele N Total Tst t1 t2 t3 t4 … cn Rt Ctrl c1 c2 c3 c4 … cn Rc Total n1 n2 n3 n4 … nn N 第三十七页，共五十二页，2022年，8月28日 HLA复合体多态性与HBV 持续感染的关系研究 遗传平衡检验： Locus Allele N Hets Homs H(O) H(E) PIC χ2 HW A 30 173 110 63 0.636 0.886 0.874 26.23 ** B 46 178 162 16 0.91 0.943 0.938 1 NS DRB1 40 181 168 13 0.928 0.921 0.914 0.9 NS **: P0.01; NS: P0.05 第三十八页，共五十二页，2022年，8月28日 HLA-A 主型、主型阳性个体频率分析 A*02 A*11 A*24 A*30 A*33 χ2 0.050 3.185 0.884 3.377 4.152 P 0.824 0.074 0.347 0.066 0.042 OR 1.052 1.555 0.682 0.403 0.337 χ2 1.188 3.047 0.205 3.992 2.152 P 0.276 0.081 0.651 0.046 0.142 OR 1.422 1.756 0.821 0.332 0.433 Statistic DF Value P Chi-Square 6 12.8601 0.0453 Likelihood Ratio Chi-Square 6 13.7038 0.0331 Phi Coefficient 0.1928 Contingency Coefficient 0.1893 Cochran-Mantel-Haenszel Statistics General Association 6 12.8229 0.0459 第三十九页，共五十二页，2022年，8月28日 HLA-A亚型、亚型阳性个体频率分析 A*0201 A*0206 A*0207 A*1101 A*1102 A*2402 A*3001 A*3303 χ2 0.114 0.115 11.450 5.073 0.087 0.704 3.377 4.152 P 0.
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