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基因组学课程论文
题目:植物基因组学的的研究进展
**:秦 冉
**植物基因组学的的研究进展
摘要:随着模式植物——拟南芥和水稻基因组测序的完成,近年来关于植物基因组学的研究越来越多。本文主要对拟南芥、水稻2种重要的模式植物在构造基因组学、比拟基因组学、功能基因组学等领域的研究进展以及研究所使用的技术方法进展简单介绍。
关键词:植物;基因组学;研究进展
Therecent progress in plant genomics research
Abstract: Withthe pletion of genome sequencing ofthe model plant-- Arabidopsis and rice,more and more researchesonplant genomicsemergein recent years.The research progress of the 2importantmodel plant--Arabidopsis and rice in structural genomics,parative genomics,functional genomicsand technologymethods used in this research?are introduced briefly in this paper.
Keywords:plant; genomics; research advances
前言
基因组是1924年提出用于描述生物的全部基因和染色体组成的概念。1986年由美国科学家Thomas Roderick提出的基因组学是指对所有基因进展基因组作图(包括遗传图谱、物理图谱、转录本图谱〕、核苷酸序列分析、基因定位和基因功能分析的一门科学。自从1990年人类基因组方案实施以来,基因组学发生了翻天覆地的变化,已开展成了一门生命科学的前沿和热点领域。而植物基因组研究与其他真核生物和人类基因组研究有很大的不同。首先, 不同植物的基因组大小即使在亲缘关系非常近的种类之间差异也很大; 其次, 很多植物是异源多倍体, 即便是二倍体植物中有些种类也存在较为广泛的体细胞内多倍化( endopolyploidy〕 现象[1]。基因组研究主要包括三个层次:①构造基因组学, 以全序列测序为目标,构建高分辨率的以染色体重组交换为根底的遗传图谱和以DNA 的核苷酸序列为根底的物理图谱。②功能基因组学,即后基因组方案〞, 是构造基因组研究的延伸, 利用构造基因组提供的遗传信息, 利用表达序列标签, 建立以转录图谱为根底的功能图谱( 基因组表达图谱〕, 系统研究基因的功能,植物功能基因组学是当前植物学最前沿的领域之一。③蛋白质组学,是功能基因组学的深入,因为基因的功能最终将以蛋白质的形式表达。
近来,以水稻( Oryza sativa〕 和拟南芥( Arabadopsis thaliana〕为代表的植物基因组研究取得了很大进展,如植物分子连锁遗传图谱的构建, 在此根底上, 已经在植物基因组的组织构造和基因组进化等方面得到了有重要价值的结论; 植物基因组物理作图和序列测定的研究集中于拟南芥和水稻上; 植物比拟基因组作图证实在许多近缘植物甚至整个植物界的局部染色体区段或整个基因组中都存在着广泛的基因共线性, 使得我们可以利用同源性对各种植物的基因组构造进展研究、分析和利用。本文主要对拟南芥、水稻2种重要的模式植物在构造基因组学、功能基因组学、比拟基因组学等研究领域的研究进展进展归纳总结。
1 拟南芥基因组学的研究
1.1 拟南芥构造基因组学研究
美国自1990 年启动植物基因组学〞方案, 2000 年底公布了模式植物拟南芥的全部序列。通过分析基因组序列能够获得基因构造的完整信息, 如基因在染色体上的排列顺序, 基因间的间隔区构造, 启动子的构造以及内含子的分布等。 Bevan[2]对拟南芥第四染色体上1. 9 Mb 的片段进展了全序列测定. 结果发现:平均每4. 8 Kb 就有一个基因存在;54% 的基因与GenBank
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