第九章蛋白质相互作用网络.pptVIP

b：研究PPIN的拓扑结构和规模，对于了解该网络的全局性能是非常重要的。 第二十九页，共四十九页，2022年，8月28日 c：研究PPIN中蛋白质复合体是至关重要的。一些蛋白质可与其他多个蛋白质结合组成蛋白质复合体。通常这些复合体可以组成一个稳定的单位，在一定时间内不会发生重大变化。但也有另一些高度动态变化的复合体可导致细胞状态和功能的改变。 第三十页，共四十九页，2022年，8月28日 蛋白质复合体的形态可转化为其他不同形态，由此可以构造一种蛋白质复合体形态演化网络。 第三十一页，共四十九页，2022年，8月28日 d：生物体内的信号转导路径、代谢路径和有关的细胞过程是构建PPIN的骨干。要了解细胞，研究和建立上述路径模型也是至关重要的。在许多信号转导和代谢路径中都有蛋白质相互作用。 第三十二页，共四十九页，2022年，8月28日 e：可根据蛋白质相互作用的关系来预测蛋白质的功能。预测蛋白质功能是目前计算生物学的一个最重要的任务。利用数据模型和计算方法，可以直接从蛋白质序列预测PPIN的结构、功能及其动力学机制。 第三十三页，共四十九页，2022年，8月28日 例如，基于假设邻近蛋白质具有相似性的聚类方法，统计“投票”方法，全局预测方法，表达谱分析的最短距离方法，概率方法，马尔可夫随机场方法和信息传递方法等各种方法。 第三十四页，共四十九页，2022年，8月28日 四、