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云南茶树种质资源数据共享平台的设计与实现吴文斗;王贤;李泓蒴;刘本英【期刊名称】《《安徽农业科学》》【年(卷),期】2019(047)024【总页数】4页(P230-233)【关键词】云南茶树;种质资源;特征数据;共享平台【作者】吴文斗;王贤;李泓蒴;刘本英【作者单位】云南农业大学大数据学院云南昆明650201;云南省农业科学院茶叶研究所云南勐海666201【正文语种】中文【中图分类】S-058种质资源是农作物品种改良的物质基础,是生物多样性和自然科技资源的重要组成部分,是大自然留给人类的宝贵财富[1],世界各国把作物种质资源建设作为一种战略,积极开展作物种质资源数据库建设。我国农作物种质资源数据库建设起步也比较早,中国作物种质信息网(CGRIS)于1991年建立[2],开启了我国种质资源数据库建设先河。此后,国内多个各具特色的农作物种质资源数据库纷纷创建,如国家水稻数据库[3]、北京农作物种质资源信息服务平台[4]、葡萄种质资源数据库[5]、烟草种质资源在线共享系统等[6-7],为开展茶叶种质资源数据库建设和应用提供了基础和借鉴。
云南作为茶树资源的起源中心和原产地,有世界上最丰富的茶树种质资源(包括野生种、农家品种、育成品种等),是世界茶组植物分类研究中所占比例最多、分布最广的地区,是我国和世界各国发展茶叶生产和开展茶树育种工作的珍贵宝库,其悠久的种茶历史和得天独厚的自然条件孕育了丰富的茶树种质资源[8-10]。茶树种质资源不仅是茶树育种、生物学研究和开发利用的物质基础,同时也是关系到国家茶叶可持续发展基本保障。茶树种质资源承载着高度的遗传多样性,是国家重大的基础战略资源和自然科技资源必不可少的基础物质条件,具有经济、文化、社会、生态等多种重要功能。
云南省农业科学院茶叶研究所建设的国家种质勐海大叶茶树资源圃经过30多年的发展和建设,已成为国内最大、保存种类最多的大叶茶种质资源保存圃。截至2015年底,国家种质大叶茶资源圃共保存种质2459份,包括山茶科山茶属25个种和3个变种,收集和积累了大量图片、农艺性状、生化成分、茶叶加工品质、抗寒性、抗病虫性等特征数据,但长期以来数字化和信息化程度相对较低,随着圃内工作的深入开展和数据量的不断增加,传统的数据调查方法和数据保存方式已不利于云南茶树种质资源的保存、管理、利用和共享,因此构建云南茶叶种质资源数据平台和共享平台势在必行。鉴于此,笔者开展了云南茶树种质资源数据共享平台研究和建设,为云南茶树种植资源的保护、开发、利用和隐在价值挖掘提供支持,具有重要价值和意义。
1平台功能构架设计云南茶叶种质资源共享平台建立的主要目的是对云南茶树种质资源信息收集、整合、存储管理、共享、决策分析和可视化展示。为相关政府部门工作人员、种质资源研究人员、茶农、茶企和公众提供云南茶树种质资源数据的查询、浏览、统计和比较等服务。按照平台管理内容,可划分为种质资源信息管理、系统管理、权限认证和数据管理四大核心系统,采用面向对象分析方法,平台功能包结构如图1。
其中,种质资源子系统是云南茶叶种质资源共享平台的核心,整个平台的其他功能都是服务于种质资源的共享和使用,种质资源子系统有7个模块,包括品种资源、品质特征、土壤养分、科普文化、统计报表、病虫害信息以及信息规范与标准,各核心模块之间相互协作、相互独立,符合高内聚低耦合的设计理念。
品种资源是特别复杂的数据,包括矢量空间、地理信息数据、地形地貌、植被群落、气候条件、小生境、理化检测成分分析、矿物质分析、价值功效、植物形态学特征以及科普文化资源等信息。品种资源包共有7个类,分别用于记录和存储种质资源的矢量空间、地形地貌、小生境、气候条件、地理信息、植被群落以及茶树种属等信息,详细记录和描述了品种资源的各个方面,形成比较完善的品种资源数据库,其实体类如图2所示。
图1云南茶树种质资源数据库平台包Fig.1PlatformpackofgermplasmresourcesdatabaseofYunnanteatrees图2品种资源实体类Fig.2Entityclassesofvarietyresources品质特征主要是指茶叶理化分析成分与矿物质分析的特征数据,是茶叶检测标准的数据呈现,同时可分析和界定古茶树的价值功效。
病虫害信息包含病害和虫害,病虫害类主要是记录和存储病虫害的种类、名称、症状、分布规律、防治要点及药指导等信息,建立古茶树病虫害识别、查询、预测、防治和用药指导较完整的体系。
科普文化资源是对茶山地区的古茶山、古茶园文化、古茶庄、茶马古道、名族茶艺、茶园风情、茶的传说及其他茶文化遗迹资源的收集、整理、分析和存储。
土壤养分主要是对土壤中大量元素、微量元素、重金属元素的种类、含量和分布等进行数据采集、整理、分析和存储,为古茶树的生长环境、病虫害防治以
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