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ICS 65.020.01
CCS B16
DB53
云 南 省 地 方 标 准
DB53/T 1145—2023
切花百合病毒种类高通量鉴定和检测技术
规程
2 0 2 3 - 0 2 - 2 3 发 布 2023-05-23实施
云南省市场监督管理局 发 布
I
DB53/T 1145—2023
前 言
本文件按照GB/T 1.1—2020 《标准化工作导则 第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定 起草。
本文件的某些内容仍可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。
本文件由云南大学提出。
本文件由云南省花卉标准化技术委员会(YNTC 08)归口。
本文件起草单位:云南大学、宁波大学。
本文件主要起草人:王建光、彭杰军、陈剑平、燕飞、鲁宇文、郑红英、吴官维、饶绍飞。
1
1145—2023DB53/T
1145—2023
切花百合病毒种类高通量鉴定和检测技术规程
1 范围
本文件规定了切花百合病毒种类高通量鉴定和检测的术语和定义、样品采集与处理、切花百合病毒 种类高通量鉴定和检测方法以及结果判定的技术要求。
本文件适用于已报道的切花百合病毒种类的鉴定。
2 规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件, 仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本 文件。
GB/T 28071 黄瓜绿斑驳花叶病毒检疫鉴定方法
GB/T 30989 高通量基因测序技术规程
GB/T 35537 高通量基因测序结果评价要求
GB/T 35890 高通量测序数据序列格式规范
GB/T 40664 用于高通量测序的核酸类样本质量控制通用要求
NY/T 402 脱毒甘薯种薯(苗)病毒检测技术规程
NY/T 1744 切花百合脱毒种球
3 术语和定义
GB/T 30989—2014、GB/T 35890—2018、GB/T 40664—2021及NY/T 1744—2009界定的以及下列术 语和定义适用于本文件。为了便于使用,以下重复列出了GB/T 30989—2014、GB/T 35890—2018、GB/T 40664—2021及NY/T 1744—2009中的某些术语和定义。
3.1
切花百合病毒病 cut lily virus diseases
指由单一或复合病毒侵染百合植株造成植株矮化、花朵变小;叶片花叶、褪绿、斑驳、规则或不规 则坏死斑、畸形等疑似病毒为害症状的病害。
[来源:NY/T 1744—2009,4.23, 有修改]
3.2
高通量测序 high-throughput sequencing
又称“下一代测序技术” (Next-generation sequencing technology), 区别于传统双脱氧测序, 是指一种能够一次并行对大量核酸分子进行平行序列测定的技术,通常一次测序反应能产生不低于100 Mb的测序数据。
[来源: GB/T 30989—2014,7.24, 有修改]
3.3
测序片段 reads
2
DB53/T 1145—2023
高通量测序平台产生的含有碱基序列和质量值的序列片段。
[来源: GB/T 35890—2018,2.6]
3.4
转录组高通量测序 transcriptome high-throughput sequencing
基于高通量平台,针对细胞内某一功能状态下所能转录出来的所有RNA(主要包括mRNA和非编码RNA), 进行平行序列测定的技术,通常一次测序反应能产生不低于100 Mb 的测序数据。
3.5
过滤片段 clean reads
指高通量测序reads序列过滤后的测序片段。
3.6
测序通量 throughput of gene sequencing
单次测序可获得序列信息的基因片段数量或可测定的脱氧核糖核酸 (以碱基表示)数量。
[来源: GB/T 30989—2014,7.24]
3.7
核苷酸 nucleotide
构成核酸的基本单位,由五 碳 糖、磷酸和环状的含氮碱基三部分组成
[来源: GB/T 30989—2014,7.24],
3.8
测序读长 read length o f gene sequencing
测序能测的最长基因片段,通常 以碱基数表示。
[来源: GB/T 30989—2014,7.24]
3.9
碱基识别质量 quality of base calling
衡量碱基正确识别的概率,通常以 数字值表示0表示碱基识别 质量,Q20表示测序质量值大
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