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AutoDockVina（简称 Vina）是一款免费开源的分子对接软件，由美国斯克利普斯研究所
（TheScrippsResearchInstitute）OlegTrott 博士开发。Vina 在 AutoDock4 的基础上做了极大的改进， 主要是算法上的改进，促使它在结合模式预测的平均准确率和计算速度方面都远超 AutoDock4。更多介绍请访问：
Vina 有 Windows、Linux、MacOSX 等不同系统版本以及源代码。可从这里免费：
Vina只负责对接计算，它并不提供蛋白大分子和配体小分子的准备功能。该部分功能则由MGLTools
来完成。因此，通常也需要安装 MGLTools 下面简单讲解 Vina 和 MGLTools的安装。Windows 系统中安装 Vina
1、双击点击二进制文件 autodock_vina_1_1_2_win32.msi，按提示点击安装即可。2、由于 Vina 没有用户图形界面（GUI），因此，不会在开始菜单栏出现。默认安装在
C:\ProgramFiles\TheScrippsResearchInstitute\Vina，或者C:\ProgramFiles(x86)\TheScrippsResearchInstitute\Vina 下面。
3、为 Vina 设置环境变量，方便以后使用。请参考博文：《如何设置环境变量》Linux 系统中安装 Vina
1、敲以下命令，解压文件 autodock_vina_1_1_2_linux_x86.tgz： tarxzfautodock_vina_1_1_2_linux_x86.tgz
2、解压后在 bin 文件夹中找到 vina 和 vina_split，前者即为对接程序 Vina。3、敲以下命令，赋予 vina 和 vina_split 执行权限：
chmod+xvina chmod+xvina_split
或者一行命令：chmod+xvina*
4、设置环境变量，请参考博文：《如何设置环境变量》Windows 系统中安装 MGLTools
双击点击二进制文件
Linux 系统中安装 MGLTools
1、据实际情况，选择 32 位或者 64 位的 MGLTools
2、敲以下命令，进入该目录： cd/home/software
3、敲以下chmod
4、敲以下命令，执行安装：
5、会弹出与 Windows 下一样的安装界面，按提示点击安装即可。
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