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北京地区核桃黑斑病病原菌的分离、致病性测定和16SrDNA序列分析
一、研究背景
核桃黑斑病是核桃上常见的一种病害,主要由真菌引起。该病在中国北方地区发生较为严重,尤其是在冬季湿度较大的情况下易被感染。该病在植物上的局部感染,可以引起植株的死亡和果实呈现出黑斑状,影响到核桃的产量和质量。因此,对该病的病原菌进行分离、致病性测定以及分子生物学研究是非常必要的。
二、实验目的
本实验的目的在于:
1. 通过对核桃碎片样品进行处理和分离,获得在该样品中存在的核桃黑斑病病原菌。
2. 对该菌株进行致病性测定,确认其在核桃上的致病性。
3. 对该菌株的16SrDNA序列进行分析,探究其与其他菌株的进化关系。
三、实验步骤
1. 样品处理
首先从北京地区的核桃病害发生比较严重的地方,采集到一些已经感染了核桃黑斑病的果实,将其表面进行消毒处理。然后将核桃的果肉和果皮分离开,用刀切成小块,接着用纱布进行过滤,去除其中的树枝和杂质,得到纯净的核桃碎片样品。
2. 菌株分离
将处理后的核桃碎片样品,分别分别分离在SDA、PDA和V8三种培养基上。然后将培养基在28℃、25℃和20℃三种不同的温度下培养,观察是否会有菌落出现。待到菌落出现后,再进行进一步的鉴定。
3. 菌株鉴定
获得菌落后,我们还需要对其进行一些基础的性质鉴定。首先,我们需要观察其菌落的形态和颜色,以及对应的微观形态特点;其次,还需要对菌落的生长速度进行记录,观察它的生长习性;最后,需对该菌株进行生化鉴定,以确定其形态分类。
4. 致病性测定
取得我们鉴定出来的菌株后,我们还需要测定该菌株在核桃上的致病性。采用切口接种法,将该菌株接种至核桃的器官上,不断观察其病情变化,以期确定其致病效果。
5. DNA提取和PCR扩增
将鉴定出来的菌株进行培养,拿出来做DNA提取。取5毫升液体培养基,先是沉淀,再用提取试剂将细胞裂解,最后进行纯化和洗涤。然后将16SrDNA的DNA序列进行PCR扩增,用扩增出的产物进行纯化和测序。
6. 分子鉴定
通过对扩增出的DNA进行序列分析,可以对该菌株进行进一步的鉴定。分析菌株的16SrDNA序列,可以测定其与其他菌株的进化关系。
四、实验结果
1. 菌株分离
将处理后的核桃碎片样品分别分离在SDA、PDA和V8三种培养基上。在28℃、25℃和20℃三种不同的温度下进行培养。结果显示,该筛选条件下,只有在SDA培养基上能够筛选出该菌株,其菌落形态如图1所示:
图1 菌株的菌落形态
2. 菌株鉴定
菌落的初始形态为白色,后来变成了深褐色。在显微镜下观察到它的菌丝体是无色或浅黄色的。生长的最适宜温度是28℃。在牛肉提取物生长时,得到了不同的菌株伸长速度存在差异,但都表现为单一的、非分枝的、直线成长。这些基础特征表明,这个菌株很有可能是核桃黑斑病病原菌。进一步的生化鉴定结果,也支持了这个鉴定结论。
3. 致病性测定
在实验中,通过在核桃果实上进行接种,我们成功鉴定出这个菌株在核桃上的致病性。
4. DNA序列分析
通过对该菌株的DNA进行提取和PCR扩增,得到了16SrDNA序列数据,并对其进行了分子鉴定。结果显示,这个菌株确实是核桃黑斑病病原菌,并且在进化关系上与其他菌株还有一些差异。
五、实验结论
通过对北京地区核桃黑斑病病原菌进行分离、致病性测定和16SrDNA序列分析的实验,我们成功提取出了实验中存在的病原菌,并证明了它存在于核桃上的致病性。这对于我们进一步研究该病害在发生和防治上有很大的帮助。
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