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一种基于NGS数据处理中消除背景提高目标位点检测灵敏度的方法.pdfVIP

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  • 2023-05-31 发布于四川
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一种基于NGS数据处理中消除背景提高目标位点检测灵敏度的方法.pdf

    本发明公开了一种基于NGS数据处理中消除背景提高目标位点检测灵敏度的方法，在计算所有突变位点的突变频率后，目标位点的突变频率扣除阴性对照样本突变频率后，将非目标位点的突变频率作为背景信号，设定一预定条件，利用背景信号进行过滤处理，保留过滤后的目标位点；进一步考虑目标位点本身的突变频率以及它与突变频率最大的非目标位点的差异；这两者的因素量化为TotalScore，根据不同的样本类型，依据标准品确定不同的阈值后，就可以根据TotalScore结果确定位点的阴阳性。该方法可适用于cfDNA、FFPE样

    (19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 115798583 A (43)申请公布日 2023.03.14 (21)申请号 202211658759.X (22)申请日 2022.12.22 (71)申请人 上海桐树生物科技有限公司 地址 2

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