生物医学文本挖掘及其应用.pptxVIP

生物医学文本挖掘及其应用第1页/共115页 目的介绍生物信息学文本挖掘工具文本挖掘不再是信息专业的领域第2页/共115页 2023/5/31例子：二者关系进行性多灶性白质脑病（progressive multifocal leukoencephalopathy，PML） 抗体antibodiesMonoclonal antibodies，efalizumab（依法珠单克隆抗体） 第3页/共115页 自然语言处理让计算机替我们看文献吧！比较难：计算机需要专门的知识才能读懂文本。自然语言处理（Natural Language Processing ，NLP）：专门训练计算机掌握这种知识的学科。生物医学文本挖掘（Biomedical text mining ）是一个专门处理生物学、医学和化学文本的分支学科。也叫BioNLP有些人把NLP当做text mining的同义词。第4页/共115页 5Biomedical text 生物医学文本的格式多种多样：病历科研论文序列注释公共健康指南文本的内容多样化，如习惯用语临床有临床上的行话实验室有自己对蛋白的命名方式这种差异造成了文本挖掘应用往往面向特定类型的文本。尤其是对Medline文摘记录的分析。易获取免费第5页/共115页 基本概念（1）术语（Term）：专门领域里的名称。术语集（terminology）：术语的集合。生物医学文本中到处是术