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- 2023-06-07 发布于湖北
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枣响应植原体侵染及恢复的转录组和蛋白组分析
背景与目的:
枣(Ziziphus jujuba Mill.)是我国,特别是黄土高原地区的主要果树栽培品种之一。枣是重要的农业经济作物之一,对于我国果树业的发展和推广具有重要的意义。枣树的生长和发育受到植原体(phytoplasmas)的侵染会导致生长迟缓,叶片变黄,产量下降等症状,对枣树的生长生产产生严重的影响。因此,研究枣树响应植原体侵染的机制和恢复机制,对于揭示枣树-植原体互作的分子机制和开发健康的新品种具有重要的意义。
方法:
本文采用转录组和蛋白组联合分析研究枣树响应植原体侵染和恢复的分子机制。采用RNA-Seq技术对健康枣树和植原体侵染枣树的转录组进行测序分析,通过GO,KEGG富集分析和差异基因功能注释来筛选出与植原体侵染相关的基因。同时,采用蛋白质组学的方法对健康枣树和植原体侵染枣树的蛋白组进行测定,通过二维电泳,液相质谱分析,功能注释和蛋白互作网络分析来挖掘响应植原体侵染和恢复的关键蛋白。
结果:
转录组测序共测得44,572个蛋白编码基因。GO分析结果显示,响应病原体侵染的基因主要涉及到光合作用,碳代谢和免疫防御等生物过程。KEGG通路分析表明,这些差异基因主要参与到刚果病,秦岭黄原病,和黄矮病等植原体感染通路。此外,差异基因还涉及到细菌感染和免疫防御,如植物生长激素的代谢通路、植物免疫的调节、蛋白降解及互作等。蛋白组
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