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本发明公开了一种基因组完成图的基因组组装方法，首先使用高保真测序数据(HiFi)进行基因组组装，生成重叠群、重叠群路径、边信息和重叠信息；将重叠群锚定在参考基因组的染色体上，得到锚定结果；将重叠群路径按照的锚定结果连接成染色体路径；对于每条染色体，按照重叠群在染色体路径的位置在字符串图上遍历每个重叠群，并为每一对重叠群之间的缺口寻找最短路径并填补缺口。本发明实现了高保真测序(HiFi)的无缺口动植物基因组组装完成图，并且完成图准确性高、质量好。
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 112786109 A
(43)申请公布日 2021.05.11
(21)申请号 202110069693.X
(22)申请日 2021.01.19
(71)申请人 南京大学
地址 21
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