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- 2023-06-21 发布于四川
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本发明公开了一种基于Hadoop的基因组索引构建的分布式并行计算方法，包括以下步骤：步骤1：数据输入，将区间起止索引值作为输入数据；步骤2：Map映射，每个Map任务接收一个区间段的起止索引值，Map映射对索引范围内的每个索引代表的基因组后缀计算k‑mer值；步骤3：数据分区，采用数据分区算法根据k‑mer值将健值对分为与Reduce任务数量相同的多个数据分区；步骤4：数据混洗，将k‑mer值相同的键值对合并；步骤5：数据规约，对每个k‑mer值相同的数据集合进行局部排序；步骤6：任务清理，按数
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 111028897 A
(43)申请公布日
2020.04.17
(21)申请号 20191
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