一种基于PHMM模型的差分可辨性基因序列聚类方法.pdfVIP

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  • 2023-06-21 发布于四川
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一种基于PHMM模型的差分可辨性基因序列聚类方法.pdf

本发明公开了一种基于PHMM模型的差分可辨性基因序列聚类方法,包括以下步骤:步骤一:初始化算法迭代轮数r=1;随机生成K个ProfileHMM模型步骤二:计算序列数据对每个ProfileHMM模型输出的分数,按最高分数将序列划分到相应的聚类;步骤三:确定该轮迭代差分可辨性隐私参数ρr;步骤四:计算每个ProfileHMM模型的状态转移概率和发射概率;对计算得到的发射概率添加噪声;步骤五:计算每个ProfileHMM模型与上一轮迭代时之间的散度距离,若散度距离的和小于预设的阈值,则输出聚类

(19)国家知识产权局 (12)发明专利 (10)授权公告号 CN 113380330 B (45)授权公告日 2022.07.26 (21)申请号 202110738987.7 CN 112585687 A,2021.03.30

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