微生物的分类鉴定详解演示文稿.pptVIP

在疑难菌株鉴定、新种命名、建立一个新的分类单位时，G+C含量是一项重要的，必不可少的鉴定指标。 其分类学意义主要是作为建立新分类 单元的一项基本特征和把那些G+C含 量差别大的种类排除出某一分类单元。 G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定 当前第30页\共有54页\编于星期四\17点 2、核酸的分子杂交 不同生物DNA碱基排列顺序的异同直接反映生物之间 亲缘关系的远近，碱基排列顺序差异越小，它们之间 的亲缘关系就越近，反之亦然。 直接分析比较DNA的碱基排列顺序 ------由于技术上的困难目前尚难以普遍地进行； 核酸分子杂交(hybridization)间接比较不同微生物DNA 碱基排列顺序的相似性 当前第31页\共有54页\编于星期四\17点 1）DNA-DNA杂交； （亲缘关系相对近的微生物之间的亲缘关系比较） 2）DNA-rRNA杂交； （亲缘关系相对远的微生物之间的亲缘关系比较） 3）核酸探针； （利用特异性的探针，用于细菌等的快速鉴定） 当前第32页\共有54页\编于星期四\17点 当前第33页\共有54页\编于星期四\17点 当前第34页\共有54页\编于星期四\17点 特异性的探针主要用于 病原微生物的快速鉴定 当前第35页\共有54页\编于星期四\17点 3、电子杂交 随着微生物基因信息，特别是全基因组完全测序的不断增加，我们可以通过各种计算机软件对不同物种的遗传信息进行直接比较，从而分析不同微生物间的亲缘关系。 当前第36页\共有54页\编于星期四\17点 蛋白质、RNA和DNA序列进化变化的显著特点是进化 速率相对恒定，也就是说，分子序列进化的改变量 (氨基酸或核苷酸替换数或替换百分率)与 分子进化的时间成正比。 4、16S rRNA编目分析 a）在两群生物中，如果同一种分子的序列差异很大时， ------------进化距离远，进化过程中很早就分支了。 b）如果两群生物同一来源的大分子的序列基本相同， ------------处在同一进化水平上。 当前第37页\共有54页\编于星期四\17点 16S rRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的“分子尺”： 1）rRNA具有重要且恒定的生理功能； 2）在16SrRNA分子中，有高度保守、中度保守和高度变化序列区域，因而它适用于进化距离不同的 各类生物亲缘关系的研究； 3）16SrRNA分子量大小适中，便于序列分析； 4）rRNA在细胞中含量大(约占细胞中RNA的90%)，也易于提取； 5）16SrRNA普遍存在于真核生物(同源分子是18SrRNA)和原核生物中。因此它可以作为测量各类生物进化的工具。 4、16S rRNA编目分析 当前第38页\共有54页\编于星期四\17点 微生物的分类鉴定详解演示文稿 当前第1页\共有54页\编于星期四\17点 优选微生物的分类鉴定 当前第2页\共有54页\编于星期四\17点 形成于35亿年前的微生物化石 主要是些类似简单杆状细菌的原始生物 形成于8.5亿年前的微生物化石 20亿年前以后的岩石中的微生物的化石形态多样性明显增多 当前第3页\共有54页\编于星期四\17点 形成于10亿年前的微生物化石 形态上非常类似于现代的蓝细菌， 进行不产氧光合作用的光能自养 菌，及化能无机营养的硫细菌。 形态上类似于现代的绿藻（真核生物） 当前第4页\共有54页\编于星期四\17点 当前第5页\共有54页\编于星期四\17点 微生物分类学的基本任务： 对已知的大量的提炼出分类单元 1、分类 2、鉴定 3、命名 给新发现物种命名（一般用拉丁语） 对未知的个别的进行鉴定，归入分类系统 当前第6页\共有54页\编于星期四\17点 一 分类单元 界（Kingdom） 门（Phylum或Division） 纲（Class） 目（Order） 科（Family） 属（Genus） 种（Species） 第一节 通用分类单元 当前第7页\共有54页\编于星期四\17点 二 种的概念 动物的种：凡两个能互相交配产生具有有性生殖能力的物种。 微生物的种：是最基本的分类单元，它是表型特征高度相似，亲缘关系极其相近，与同属内的其它种有着明显差异的菌株的总称。 菌株（Strain）：任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种的种群（纯培养物）及其一切后代。 模式菌株（种）：是被指定的代表一个种的菌株，该菌株具有此种的各个典型形状，即具体的种。 当前第8页\共有54页\编于星期四\17点 Bacillus subtilisASI.398 Bacillus subtilisBF7658 生产蛋白酶 生产α淀粉酶 当前第9页\共有54页\