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- 2023-07-31 发布于上海
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清开灵单一组分干预缺血小鼠海马细胞分子药理机制的生物信息学研究的开题报告
题目:清开灵单一组分干预缺血小鼠海马细胞分子药理机制的生物信息学研究
研究背景:
清开灵是一种中药制剂,具有清热解毒、祛风止痛、降血脂等作用,在临床应用中被广泛应用于治疗风湿关节炎、肝炎等疾病。近年来有研究表明,清开灵对神经系统具有保护作用,可预防和改善中风后的脑缺血损伤等。然而清开灵对缺血性脑损伤的分子机制尚未完全阐明。
研究目的:
本研究旨在通过生物信息学手段,深入探究清开灵单一组分干预缺血小鼠海马细胞分子药理机制。
研究内容及方法:
1. 建立缺血小鼠海马细胞模型:通过动脉硬化、高血压等因素造成缺血小鼠海马细胞的损伤,建立缺血小鼠海马细胞模型。
2. 给药处理:清开灵单一组分治疗小鼠海马细胞模型,采用不同剂量清开灵单一组分干预模型小鼠,收集小鼠海马组织,提取总RNA。
3. 文库建立及高通量测序:将总RNA转录成cDNA,建立RNA-Seq文库,通过BGISEQ-500高通量测序平台进行测序,获得清开灵单一组分治疗和对照组小鼠海马细胞的基因表达谱。
4. 数据预处理:将原始测序数据进行数据质量控制、序列比对、转录本定量等步骤,得到符合要求的基因表达谱数据。
5. 比较基因组学分析:采用DESeq2差异表达基因筛选,比较清开灵单一组分治疗组与对照组小鼠海马细胞的差异基因,设计功能富集分析、通路分析以及调控
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