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喜马拉雅-横断山区马先蒿属植物的物种分化和分子鉴定的中期报告
本研究旨在探讨喜马拉雅-横断山区马先蒿属植物的物种分化和分子鉴定,现在进行中期报告。
1. 研究对象的选取和采样
在喜马拉雅-横断山区选择了马先蒿属植物作为研究对象,包括已有分类学鉴定的物种以及未被正式命名的潜在新物种。通过采集标本和基于文献报道的野外记录信息进行选择,确认采样点位和采集时间。截至目前,共计采集了20个样本。
2. DNA提取和PCR扩增
选取了ITS、matK和rbcL三个基因序列进行扩增和分析。对采集的样本进行DNA提取,使用PCR扩增方法,扩增条件为:95℃预变性5min,35个循环(95℃变性1min,55℃退火1min,72℃伸长1min),72℃最后伸长10min。扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳进行检测,筛选出有效扩增产物样本进行下一步测序。
3. DNA序列测序和数据分析
对有效扩增产物样本进行Sanger测序,获得ITS、matK和rbcL三个基因序列。使用BioEdit软件进行序列拼接、编辑、比对和修正,利用MEGA软件工具进行系统分析。使用Neighbor-Joining和最大简化法构建进化关系树,利用Bootstrap法进行支持率评估。同时,利用DIFFIND软件进行种群遗传学分析。
目前,已完成所有样本的DNA提取、PCR扩增、Sanger测序等基础实验工作,并基于ITS序列同源性和演化分析,构建了物种进化树和种群进化树。物种进化树显示出不同的物种之间明显的遗传距离和分化,有一些潜在的新物种出现在分析结果中。种群进化树表明了马先蒿属植物种群的遗传多样性分布情况,以及其分布与环境因素之间的关系。下一步将进一步开展基于matK和rbcL序列的多位点比较分析,弥补单个基因序列分析的局限性,以期更全面深入地探讨喜马拉雅-横断山区马先蒿属植物的分子鉴定和进化分化问题。
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