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环境中微生物群落分析 通过分析环境中的微生物群落，我们可以了解环境中微生物的组成和功能。然而，环境中微生物群落的结构非常复杂，不同自然界环境中微生物的组成不同。据估计大多数环境样品中,可以在实验室人工条件下获得纯培养的微生物种类只占微生物总量的1%甚至更少,因此应用传统的微生物分离培养方法并不能真实地反映环境中微生物的多样性。分子生态学研究方法可克服传统微生物学分离培养方法的不足,从分子水平反映该环境中微生物的种类组成和结构。因此,近年来分子生态学研究方法正在被越来越多的微生物学工作者所采用。 1 基因多样性对基因水平的影响 PCR方法作为强大的分子生物学工具,可以有目的地扩增DNA片段,自20世纪末被用于研究基因的多样性以来,极大地促进了基因水平的研究。在原核生物中16S rDNA基因比较保守并且还具有一定的变异性,因此应用PCR的方法将样品的16S rDNA进行扩增,对序列进行分析比较,进而对样品的原核微生物结构组成进行研究。 1.1 环境生物的多样性 首先以PCR扩增环境样品中的16S rDNA,接着将之与载体连接,经过转化和鉴定了阳性克隆以后,就得到了16S rDNA克隆文库。然后对每一个阳性克隆子进行测序和分析,就可以研究环境中原核微生物的组成。这一方法目前已经被广泛运用于土壤、海洋、湖泊、热泉等多种生态系统中原核生物多样性的检测,并且能揭示环境中前所未知的微生物的种类