circRNA影响胃癌发生发展及其机制的研究进展.docx

? ? circRNA影响胃癌发生发展及其机制的研究进展 ? ? 吴雨林,楼晓军,范依静 吴雨林,范依静,浙江中医药大学第四临床医学院 浙江省杭州市 310053 楼晓军,浙江中医药大学附属嘉兴市中医医院消化内科 浙江省嘉兴市 314000 0 引言 胃癌(gastric cancer,GC)作为癌症相关死亡的第四大原因[1],是全球目前所重视的主要公共卫生问题之一.环状RNA(circular RNA,circRNA)在最初并未受到较多关注,在长达三十余年时间内被认为是细胞内mRNA剪接错误导致的无功能副产物[2].随后,由于分子生物学领域的不断进步和高通量测序等技术的广泛使用,circRNA的研究持续完善不断扩充,许多数据支持circRNA在胃癌发生发展中的作用.据报道,多种circRNA在胃癌组织或细胞系中异常表达,探索胃癌相关circRNA作为生物标志物或靶点的机制及潜能将为胃癌早期诊断、预后和有效治疗提供新的方向和可能性,具有明确的临床意义. 1 circRNA概述 1.1 circRNA的发生和类别 CircRNA作为一种缺少5′端和3′端的共价闭合环状结构的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),由一种称为反向剪接的非常规方式产生.在反向剪接过程中,下游的5’剪接供体部位与上游的3’剪接受体部位共价连接,同时剪接体移除全部或部分内含子后其余序列再次连接,形成单链共价闭合环[3].常规剪接点的突变或使用剪接体的通用抑制剂异银杏双黄酮,均可一定程度上抑制反向剪接从而减少circRNA的产生[4],这表明circRNA的反向剪接利用了常规剪接体或线性剪接相同的剪接位点.具体circRNA类别及形成方式见图1. 1.2 circ RNA合成的可能机制 既往有报道阐述了circRNA的4种可能形成机制[4,10]: (1)套索驱动的环化: 一个外显子的3′端与另一外显子的5′端通过核糖体蛋白的连续组装形成套索结构,导致外显子跳读并驱动环化形成circRNA;(2)反向重复序列驱动的环化: 含有反向重复元件的两个内含子,如Alu元件,由互补的碱基配对,使下游剪接位点与上游剪接位点紧密接近,构成并排的双链,推动环化反应从而形成circRNA;(3)RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)驱动的环化: 内含子中RBPs的保守结合序列通过结合外显子侧翼的内含子,引起下游内含子与上游内含子的相互作用而促进环化,原理基本同(2);(4)tRNA前体剪接途径: tRNA剪接内切酶复合体(tRNA splicing endonuclease complex,TSEN)识别bulge-helix-bulge(BHB)序列,再切除tRNA前体的内含子,连接末端形成tRNA和tRNA内含子circRNA.然而目前circRNA 生成的具体机制尚未明确,相关证据并不充分,仍需要持续且更深入的研究. 2 circRNA 经典功能角色与胃癌发生发展机制的关系 circRNA以不同的角色发挥其功能(图1),影响胃癌发生和进展.在此,我们讨论了circRNA主要的作用机制,并通过特定的例子说明其与胃癌的关系. 图1 circRNA的形成、分类及其相关角色功能.(A)内含子circRNA: 当一个或多个内含子在不受脱支酶介导的线性化的情况下可保持环状形态,从而产生内含子circRNA[5];(B)外显子circRNA: 在细胞核或线粒体中由单个或多个外显子组成[6];(C)外显子-内含子circRNA: 当外显子circRNA保留部分内含子序列的条件下便可形成[7];(D)tRNA内含子circRNA: 由tRNA前体剪接后形成[8];(E)Readthrough circRNA: 是转录终止失败而得到的产物,包含来自相邻基因中的外显子[9];(F)融合circRNA: 发生于染色体易位过程中,包含来自两个远距离基因中的外显子[9].(1)miRNA海绵: 与相应的miRNA吸附结合影响下游信号通路;(2)蛋白质海绵: 与蛋白质结合影响其功能及活性;(3)调控基因表达: 通过与U1核内小核糖核蛋白结合,调节RNA聚合酶Ⅱ的活性,在转录水平上调控基因的表达;(4)蛋白质支架: 作为支架来增强酶反应动力学;(5)翻译模板: 可编码特殊的多肽或蛋白并具备相关生物学功能.Intron: 内含子;Exon: 外显子;mRNA: 信使核糖核酸;Pre-mRNA: 信使核糖核酸前体;RBPs: 核糖核酸结合蛋白;Pre-tRNA: 转运核糖核酸前体;ciRNA: 内含子环状核糖核酸;EcircRNA: 外显子环状核糖核酸;EIcircRNA:外显子-内含子环状核糖核酸;tRNA: 转运核糖核酸;tricRNA: 转运