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地理与生物信息学院
2011 / 2012 学年第 二 学期
实 验 报 告
课程名称: 医学信号处理
实验名称: 基本尺度熵算法实现
班 级 学 号:
学 生 姓 名: AAAA
指 导 教 师: BB
日 期: 2012 年 6 月
实验题目:
Matlab软件处理生物医学数字信号(熵方法2)
二、实验要求:
基本尺度熵算法实现
实验内容:
能使用Matlab软件编写、实现基本尺度熵算法并处理生物医学信号。
实验过程:
对于数据长度为的时间序列:
,
把该时间序列嵌入维相空间[19]。对于每一个,取个点组成一维矢量:
, (1)
这里是嵌入维数,是延迟时间。取,那么共有个维矢量。对于每一个维矢量,计算出基本尺度,定义为维矢量中所有相邻点数据间隔(或大小)的差值方均根值,即
. (2)
根据基本尺度选择符号划分标准为,然后把每一个维矢量转换成维矢量符号序列={ }, ()。具体的转换如下:
这里。代表第个维矢量的平均值,代表第个维矢量的基本尺度,符号0,1,2,3 仅仅作为每一个划分区域的记号,具体数值的大小并没有实际的意义。是一个特殊参数。值从0.1到2都可以。
为了计算基本尺度熵值,先统计维矢量符号序列的分布几率。包含0,1,2,3四种符号的维矢量符号序列(-共有种不同的组合形式。统计每一种不同的组合形式在整个个维矢量所占的几率:
其中,#表示个数。
维矢量的基本尺度熵定义为:
, (4)
算法代码
clear;
yf=textread(d:\Apb_100_5.txt);
N=5000;
random=fix(rand(1)*10000);
u(1:N)=yf(random:(random-1+N),2)*100+2100;
m=3;L=1;a=1;
for i=1:N-m+1
for k=1:m
X(1:N-m+1,k)=u(k:(N-m+k));
end
bs=0;
for j=1:m-1
bs=bs+(u(i+j)-u(i+j-1)).^2;
end
BS(i)=sqrt(bs/(m-1));
clear bs;
uave(i)=mean(X(i,:));
for k=1:m
if u(i+k-1)uave(i)+a*BS(i)
S(i,k)=1;
else if u(i+k-1)uave(i)
S(i,k)=0;
else if u(i+k-1)uave(i)-a*BS(i)
S(i,k)=2;
else
S(i,k)=3;
end
end
end
end
SX(i)=100*S(i,1)+10*S(i,2)+S(i,3);
end
p=hist(SX,unique(SX))/(N-m+1);
H=-sum(p.*log2(p))
实验结果:
对数据进行采样分析,求得其3维矢量的基本尺度熵为:
当a=1时,H=3.7355;当a=0.15时,H=3.7768
五、实验小结:
此次实验使用Matlab软件编写、实现基本尺度熵算法并处理生物医学信号。关键是基本尺度选择符号划分标准为,然后把每一个维矢量转换成维矢量符号序列。通过此次试验,对基本尺度熵算法有所了解,进一步熟悉了Matlab编程。
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