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基于二代测序技术的葡萄群体人工选择作用的研究的中期报告 一、研究背景 葡萄是全球最重要的经济作物之一，广泛栽培于全球各大洲，其果实被广泛用于酿造葡萄酒、醋等。随着人们对葡萄种质资源的深入研究，越来越多地揭示了人工选择对葡萄遗传变异和多样性的影响。 传统的遗传学方法主要是基于表型分析，而二代测序技术的发展为研究葡萄人工选择提供了新的手段。通过对葡萄种群进行基因组测序，可获得更高效的DNA标记，用于研究葡萄遗传多样性和选择历史。因此，本研究使用二代测序技术来研究葡萄群体人工选择的作用。 二、研究内容和方法 本研究选择了30个葡萄品种，包括10个欧洲品种、10个亚洲品种和10个美洲品种，采用Illumina HiSeq X Ten平台建立基因组测序库，并对这些样本进行二代测序。 通过数据分析，本研究将研究重点集中在了胶原类和关键基因，使用全局比对来识别单核苷酸多态性（SNP）位点，将其应用于基于距离的聚类和主成分分析（PCA）中。 三、预期结果 本研究预期结果为： （1）确定葡萄人工选择作用的影响，包括欧洲、亚洲和美洲葡萄种群的人工选择历史； （2）利用SNP标记分析建立葡萄品种间的关系，包括树状图和主成分分析； （3）对研究结果进行分析和讨论，得出结论并制定相关策略。 四、研究意义 本研究将有助于了解葡萄的人工选择历史以及区域性基因流程度，为揭示葡萄遗传多样性和选择历史提供新的手段和方法。这对于保护和利用葡萄资源、推广葡萄种植业以及提高葡萄品质具有重要的实际意义。