- 168
- 0
- 约4.26千字
- 约 15页
- 2023-09-24 发布于河南
- 举报
HGVS基因变异命名规则
随着基因检测技术的发展及其在临床的广泛应用,越来越多与疾
病相关的基因和变异被明确。为了让变异注释更程序化、对变异
文献的检索更全面化以及对变异的描述更标准化,建立统一而通
用的变异命名规则变得尤为重要。
HGVS
参考序列必须是是NCBI或EBI数据库中的ID,必须同时包含accession和version信息,
如NC_000023.10, NC_000023代表编号,10代表版本号。
DNA
• g. = 线性基因组参考DNA序列
• o. = 环状基因组参考DNA序列
• m. = 线粒体参考序列
• c. = 编码DNA参考序列
• n. = 非编码DNA参考序列
RNA
• r. = RNA参考序列
Protein
• p. = 蛋白参考序列
特殊字符的含义
• “+” :c.123+45AG (代表靠近内含子5’ 端的核苷酸发生变异)
• “-” :c.124-56CT (代表靠近内含子3’ 端核苷酸发生变异);c.-142CG (代表5’ UTR
区)
• “*” :c.*32GA (代表3’ UTR区);P.Trp41* (代表终止氨基酸)
• “[]
原创力文档

文档评论(0)