HGVS基因变异命名规则.pdfVIP

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  • 2023-09-24 发布于河南
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HGVS基因变异命名规则 随着基因检测技术的发展及其在临床的广泛应用,越来越多与疾 病相关的基因和变异被明确。为了让变异注释更程序化、对变异 文献的检索更全面化以及对变异的描述更标准化,建立统一而通 用的变异命名规则变得尤为重要。 HGVS 参考序列必须是是NCBI或EBI数据库中的ID,必须同时包含accession和version信息, 如NC_000023.10, NC_000023代表编号,10代表版本号。 DNA • g. = 线性基因组参考DNA序列 • o. = 环状基因组参考DNA序列 • m. = 线粒体参考序列 • c. = 编码DNA参考序列 • n. = 非编码DNA参考序列 RNA • r. = RNA参考序列 Protein • p. = 蛋白参考序列 特殊字符的含义 • “+” :c.123+45AG (代表靠近内含子5’ 端的核苷酸发生变异) • “-” :c.124-56CT (代表靠近内含子3’ 端核苷酸发生变异);c.-142CG (代表5’ UTR 区) • “*” :c.*32GA (代表3’ UTR区);P.Trp41* (代表终止氨基酸) • “[]

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