- 1、本文档共4页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
大肠杆菌和植物基因组 DNA 提取生科基 彭健鹏 2012141242048
大肠杆菌 DNA 提取方案设计
实验目的
学习并掌握细菌基因组的提取方法
提取大肠杆菌 DH5α中的 DNA 并进行质量检测实验概述
提取 DNA 的一般过程是将分散好的组织细胞在含十二烷基硫酸钠(SDS)和蛋白酶 K 的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的 DNA 溶液经乙醇沉淀使 DNA 从溶液中析出。
试验准备
实验材料:大肠杆菌 DH5α 菌液
实验试剂:LB 液体培养基,TE 溶液,10%SDS,蛋白酶 K,5mol/L NaCl, CTAB/NaCl 溶液,酚/氯仿/异戊醇,异丙醇,70%乙醇
实验仪器与用具:微量移液器,低温离心机,水浴锅,eppendorf 管,恒温摇床
实验步骤
将 2mL 培养至对数期的大肠杆菌 DH5α菌液 5000rpm 冷冻离心 10 分钟弃上清;
目的:分离大肠杆菌与其培养液。
加 190μL TE 悬浮沉淀,并加 10μL 10%SDS,1μL 20mg/mL 蛋白酶K,混匀,37℃保温 1h;
目的:裂解大肠杆菌。
加 30μL 5mol/L NaCl,混匀;
目的:盐析。NaCl 降低 DNA 在水中的溶解度且不破坏其结构,从而提取粗的DNA。在浓氯化钠(1-2M)溶液中, DNP 的溶解度很大, RNP 的溶解度很小; 在稀氯化钠(0.14M)溶液中, DNP 的溶解度很小, RNP 的溶解度很大; 0.14MNaCl-0.01MEDTA 溶解 RNP,而使 DNP 沉淀。
加 30μL CTAB/NaCl 溶液,混匀,65℃保温 20min;
目的:CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7 mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时,从溶液中沉淀。通过离心就可将 CTAB-核酸的复合物与蛋白,多糖类物质分开。最后通过乙醇或异丙醇沉淀 DNA,而 CTAB 溶于乙醇或异丙醇而除去。
(5)加入 300μL 酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)抽提,5000rpm 离心 10min, 将上清液移至干净离心管;
目的:分离蛋白多糖和 DNA,得到较纯的 DNA,若此步得到 DNA 不纯,可重复此步骤进行多次纯化。
加300μL 异丙醇,颠倒混合,室温下静止10min,沉淀DNA;5000rpm 离心 10min,沉淀DNA,加入 500μL70%乙醇,5000rpm 离心 10min,弃乙醇,吸干;
目的:将 DNA 沉淀出,进一步用乙醇促进 DNA 析出水。
取少量用光谱仪测 DNA 质量,并取少量跑电泳。目的:对 DNA 纯度的检测。
注意事项
DNA 浓度和纯度的测定方法
从提取的 DNA 样品中取出 1μL,用 TE 稀释到 100μL,用紫外/可见分光光度计,分别测定 260 nm 和 280 nm 的吸光值 OD260 和 OD280,计算检测 DNA 的纯度、浓度和产率。
(1)DNA 纯度=OD260/OD280
DNA 的纯制品的 OD260/OD280 值为 1.8,而 RNA 的纯制品的 OD260/OD280 值为 2.0。若 OD260/OD280 值高于 1.8,那么说样品中可能有 RNA 的污染;若样品中蛋白或酚的污染较严重则 OD260/OD280 值低于 1.8。
(2)DNA 浓度(ng/μL)=OD260×50μg/mL×100 倍(1 OD260=50ng/μl) (3)DNA 产率(ng/g·FW)=OD260×50μg/mL×100 倍×50μL/0.5 g (体
积/取材量)
植物基因组 DNA 提取
实验目的:
了解真核生物基因组 DNA 提取的一般原理;
掌握植物基因组 DNA 提取的方法和步骤。
实验原理:
使用液氮对植物叶片进行研磨,在保证破碎细胞的同时,会大大降低酶活,减少 DNase 对植物基因组 DNA 的降解作用。
植物提取液中含有 SDS 可溶解蛋白,使之变性从而脱离基因组 DNA。
提取液中 EDTA 同样可通过螯合金属离子从而使 DNase 丧失活性,保护植物基因组 DNA 不被降解。
实验材料:
液氮。
细胞提取液:100mmol/L Tris-HCl pH8.0,5mmol/L EDTA,500mmol/L NaCl, 1.25% SDS,1%β-巯基乙醇。
5mol/L KAC
饱和酚
氯仿/异戊醇(24:1)
异丙醇
70%乙醇
ddH O
2
实验步骤:
取 500μL 细胞提取液于 65℃水浴中加热。
研钵用液氮预冷,新鲜植物叶片(自来水清洗,蒸馏水冲洗干净),去除主体叶脉,剪成细条状,置
文档评论(0)