菲降解生物膜与河水生物膜中的功能菌群分析的中期报告.docxVIP

菲降解生物膜与河水生物膜中的功能菌群分析的中期报告 本次研究旨在通过对菲降解生物膜和河水生物膜中的功能菌群进行分析，探究两种生物膜的微生物多样性及其菌群的代谢特征。现已完成样品采集、DNA提取、16S rRNA基因扩增、高通量测序等前期工作，并初步进行了数据分析。 样品采集：本次研究选取了菲污染的地下水中的降解菌群（菲降解生物膜）样品和收集于某水源的河水生物膜样品。样品采集后存放于液氮中，保持其完整性。 DNA提取：依据菌属的代表样品提取方法，采用菌落PCR Kit进行微生物总DNA的提取，并通过Nebulization方式分离出DNA。 16S rRNA基因扩增：使用通用引物对提取出的DNA进行PCR扩增，得到长度为约1500 bp的16S rRNA基因序列，并利用生物信息学算法将序列拼接。 高通量测序：对两种样品的16S rRNA基因序列进行测序，得到大量数据。通过对数据进行分析、过滤、拆分，取得了两个样品的数据。 数据分析：使用QIIME软件对测序数据进行序列质量控制、去冗余、聚类、物种注释（选择RDP、SILVA、Greengenes数据库）分析。 初步结果：经过初步分析，我们发现菲降解生物膜样品中优势菌种主要是芳香族降解菌和好氧菌；而河水生物膜样品中以硝化菌、亚硝化菌和好氧菌为主。 下一步工作：明确每个物种的代谢通路及对物质转化的贡献，进一步分析两种生物膜的微生物多样性和菌群的代谢特征。